54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1873 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  98.75 
 
 		 1092 bp  1935    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  98.84 
 
 		 1092 bp  1943    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  99.03 
 
 		 1092 bp  1959    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1873    100 
 
 		 1036 bp  2054    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669587  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  98.84 
 
 		 1092 bp  1943    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  98.17 
 
 		 1092 bp  1887    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  98.17 
 
 		 1092 bp  1887    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  83.64 
 
 		 1125 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  89.23 
 
 		 1092 bp  73.8  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  89.23 
 
 		 1881 bp  73.8  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  93.33 
 
 		 1089 bp  65.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  93.33 
 
 		 1089 bp  65.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  93.33 
 
 		 1089 bp  65.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  93.33 
 
 		 1089 bp  65.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  93.33 
 
 		 1089 bp  65.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  93.33 
 
 		 1089 bp  65.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0765    84.27 
 
 		 1113 bp  65.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.655086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  95 
 
 		 1170 bp  63.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1080 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1080 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  95 
 
 		 1089 bp  63.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  95 
 
 		 1089 bp  63.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  95 
 
 		 1089 bp  63.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  85 
 
 		 1101 bp  63.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1080 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4091    89.29 
 
 		 273 bp  63.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1080 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1080 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1080 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1080 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1080 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1080 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1080 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1080 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1080 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1080 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1080 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  86.76 
 
 		 1092 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2612    86.76 
 
 		 2871 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0337479  normal  0.101338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1080 bp  63.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  88.46 
 
 		 1113 bp  56  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  86.44 
 
 		 1089 bp  54  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  86.44 
 
 		 1089 bp  54  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0620    94.29 
 
 		 1095 bp  54  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  88.24 
 
 		 1104 bp  54  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  88.24 
 
 		 1104 bp  54  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  88.24 
 
 		 1113 bp  54  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  88.24 
 
 		 1113 bp  54  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  87.27 
 
 		 1071 bp  54  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  94.12 
 
 		 1095 bp  52  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0757    88.89 
 
 		 558 bp  50.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424284  normal  0.0414971 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  85.71 
 
 		 903 bp  48.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1944  hypothetical protein  84.38 
 
 		 465 bp  48.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.181945  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  86.54 
 
 		 1098 bp  48.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>