52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0757 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  98.75 
 
 		 1071 bp  1051    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0757    100 
 
 		 558 bp  1106    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424284  normal  0.0414971 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  79.38 
 
 		 1086 bp  147  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  79.38 
 
 		 1086 bp  147  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1687    88.89 
 
 		 93 bp  89.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  88.52 
 
 		 1113 bp  65.9  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  88.52 
 
 		 1113 bp  65.9  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  88.52 
 
 		 1104 bp  65.9  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  88.52 
 
 		 1104 bp  65.9  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  89.09 
 
 		 1092 bp  61.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  94.59 
 
 		 1092 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 1080 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2612    94.59 
 
 		 2871 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0337479  normal  0.101338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 1080 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 1080 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 1080 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  88.68 
 
 		 1089 bp  58  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  88.68 
 
 		 1089 bp  58  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  88.68 
 
 		 1089 bp  58  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  88.68 
 
 		 1023 bp  58  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  88.68 
 
 		 1089 bp  58  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  92.68 
 
 		 1080 bp  58  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 1080 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 1080 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 1080 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 1080 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 1080 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 1080 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 1080 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 1080 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 1080 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 1080 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 1080 bp  58  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  86.89 
 
 		 1113 bp  58  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  92.5 
 
 		 1089 bp  56  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  92.5 
 
 		 1089 bp  56  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  87.27 
 
 		 1083 bp  54  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  92.11 
 
 		 729 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  92.11 
 
 		 1002 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  92.11 
 
 		 732 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  100 
 
 		 1122 bp  52  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0640    96.55 
 
 		 1040 bp  50.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  88.89 
 
 		 1092 bp  50.1  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1873    88.89 
 
 		 1036 bp  50.1  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669587  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  88.89 
 
 		 1092 bp  50.1  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  88.89 
 
 		 1092 bp  50.1  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  88.89 
 
 		 1092 bp  50.1  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  88.89 
 
 		 1092 bp  50.1  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  88.89 
 
 		 1092 bp  50.1  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3014  hypothetical protein  93.75 
 
 		 936 bp  48.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  96.43 
 
 		 1029 bp  48.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4694  hypothetical protein  100 
 
 		 1014 bp  48.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>