41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0640 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0640    100 
 
 		 1040 bp  2062    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  88.89 
 
 		 1092 bp  129  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  88.89 
 
 		 1092 bp  129  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  88.89 
 
 		 1092 bp  129  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  88.89 
 
 		 1092 bp  129  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  88.89 
 
 		 1092 bp  129  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  88.89 
 
 		 1092 bp  129  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  88.89 
 
 		 1092 bp  129  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  88.89 
 
 		 1092 bp  129  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0453  remnant of ISRSO5 transposase protein  91.67 
 
 		 585 bp  95.6  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405912 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  87.5 
 
 		 1083 bp  79.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  86.21 
 
 		 1092 bp  77.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  83.33 
 
 		 732 bp  71.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  83.33 
 
 		 1002 bp  71.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  83.33 
 
 		 729 bp  71.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  90 
 
 		 1092 bp  71.9  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0450  remnant of ISRSO5-transposase protein  85 
 
 		 540 bp  63.9  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.681921  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  94.29 
 
 		 1128 bp  54  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  87.27 
 
 		 1092 bp  54  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  87.27 
 
 		 1092 bp  54  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  87.27 
 
 		 1092 bp  54  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  88 
 
 		 1095 bp  52  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  96.55 
 
 		 1080 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0757    96.55 
 
 		 558 bp  50.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424284  normal  0.0414971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  96.55 
 
 		 1071 bp  50.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  96.55 
 
 		 1080 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  96.55 
 
 		 1080 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  96.55 
 
 		 1080 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  96.55 
 
 		 1080 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  96.55 
 
 		 1080 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  96.55 
 
 		 1080 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  96.55 
 
 		 1080 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  96.55 
 
 		 1080 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  96.55 
 
 		 1080 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  96.55 
 
 		 1080 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  96.55 
 
 		 1080 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  96.55 
 
 		 1080 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2612    96.55 
 
 		 2871 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0337479  normal  0.101338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  96.55 
 
 		 1092 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  96.55 
 
 		 1080 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  96.55 
 
 		 1080 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>