24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8247 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  92.25 
 
 		 1098 bp  864    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9090    99.07 
 
 		 1093 bp  1217    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8247    100 
 
 		 642 bp  1273    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8229    100 
 
 		 831 bp  1124    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174563  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  99.53 
 
 		 1101 bp  1241    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8196    99.69 
 
 		 1100 bp  1255    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8192    100 
 
 		 792 bp  1124    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8061    99.69 
 
 		 1096 bp  1253    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8277    98.67 
 
 		 228 bp  416  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.621562  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  89.83 
 
 		 1113 bp  69.9  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  89.83 
 
 		 1104 bp  69.9  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  89.83 
 
 		 1104 bp  69.9  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  89.83 
 
 		 1113 bp  69.9  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4092    93.18 
 
 		 489 bp  63.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  88.14 
 
 		 1113 bp  61.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  92.31 
 
 		 1089 bp  54  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  92.31 
 
 		 1023 bp  54  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  92.31 
 
 		 1089 bp  54  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  92.31 
 
 		 1089 bp  54  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  92.31 
 
 		 1089 bp  54  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1322    88 
 
 		 414 bp  52  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0940643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  88 
 
 		 1125 bp  52  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  93.94 
 
 		 1086 bp  50.1  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  93.94 
 
 		 1086 bp  50.1  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>