210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0282 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0282  aspartate racemase  100 
 
 		 236 aa  489  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1732  aspartate racemase  48.09 
 
 		 249 aa  230  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000037531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2531  aspartate racemase  49.12 
 
 		 240 aa  223  3e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0465  aspartate racemase  42.44 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1048  aspartate racemase  43.04 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.688459  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1731  aspartate racemase  37.44 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0565132  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0629  aspartate racemase  33.88 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.578464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1886  aspartate racemase  33.62 
 
 		 242 aa  124  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3003  aspartate racemase  33.33 
 
 		 518 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.145787  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0308  aspartate racemase  32.34 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1302  aspartate racemase  31.53 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00152087  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4295  aspartate racemase  31.98 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467897  normal  0.0102162 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5944  aspartate racemase  31.66 
 
 		 489 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6217  aspartate racemase  31.66 
 
 		 484 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6736  aspartate racemase  31.05 
 
 		 497 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.973623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1034  aspartate racemase  29.82 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00115826  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5339  aspartate racemase  30.3 
 
 		 487 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302098  normal  0.0375198 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1573  aspartate racemase  28.33 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0521541  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1511  aspartate racemase  29.74 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5991  aspartate racemase  29.95 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5638  aspartate racemase  30 
 
 		 499 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3504  aspartate racemase  28.11 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2418  aspartate racemase  29.63 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.790687  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2004  aspartate racemase  29.95 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.272891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2731  aspartate racemase  29.27 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3987  aspartate racemase  27.65 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.191158 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1378  aspartate racemase  30.81 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1263  aspartate racemase  29.56 
 
 		 236 aa  92  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00631674  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0452  aspartate racemase  31.63 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000396457  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4766  aspartate racemase  30.66 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.782175 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4841  aspartate racemase  30.66 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4914  aspartate racemase  30.66 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4384  aspartate racemase  28.57 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1778  aspartate racemase  31.46 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4912  aspartate racemase  30.19 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal  0.107391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4865  aspartate racemase  30.19 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.629158  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2741  aspartate racemase  28.22 
 
 		 236 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1803  aspartate racemase  30.14 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1090  aspartate racemase  29.35 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4701  aspartate racemase  26.43 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0254125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1405  aspartate racemase  28.57 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2001  aspartate racemase  27.48 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1720  aspartate racemase  26.24 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.377946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4590  aspartate racemase  27.66 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0144088  normal  0.0378027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0071  aspartate racemase  26.82 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.937931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4865  aspartate racemase family protein  30.5 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4889  probable amino-acid racemase  32.34 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3108  aspartate racemase  26.05 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1663  aspartate racemase  25.31 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.977225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1908  aspartate racemase  25.94 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0941  aspartate racemase  27.27 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0374  probable amino-acid racemase  28.15 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1222  aspartate racemase  29.49 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3181  aspartate racemase  29.41 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0092  putative aspartate racemase  24.64 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4503  aspartate racemase  29.47 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2067  aspartate racemase family protein  23.96 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2223  aspartate racemase family protein  23.96 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2007  aspartate racemase  24.37 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4873  probable amino-acid racemase  29.35 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4736  aspartate racemase  26.32 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2251  aspartate racemase family protein  24.37 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.85155e-27 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0080  aspartate racemase, putative  24.15 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4650  aspartate racemase family protein  29.47 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4485  aspartate racemase  29.35 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5005  aspartate racemase family protein  29.47 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4895  aspartate racemase family protein  30.48 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4583  aspartate racemase  29.15 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0351  aspartate racemase  28.39 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2006  aspartate racemase  23.95 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.975999  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0120  aspartate racemase, putative  24.64 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1547  aspartate racemase  24.52 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2205  aspartate racemase family protein  31.85 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3053  aspartate racemase  28.3 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1147  aspartate racemase  27.02 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4593  aspartate racemase  26.84 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243748  normal  0.631 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1020  aspartate racemase  24.19 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2497  aspartate racemase  29.87 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1970  aspartate racemase  24.26 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2793  aspartate racemase  26.67 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0902  aspartate racemase  30.82 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.311636 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2383  aspartate racemase  23.98 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3053  aspartate racemase  28.21 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2661  aspartate racemase family protein  24.49 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.561952  hitchhiker  0.0000201094 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2459  aspartate racemase family protein  23.98 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0713108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2706  aspartate racemase family protein  23.11 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2639  aspartate racemase family protein  23.98 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1375  aspartate racemase  25.53 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000098  aspartate racemase  24.88 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.220289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2048  aspartate racemase  23.04 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00935047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2656  aspartate racemase family protein  23.98 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000254701 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3120  aspartate racemase family protein  27.22 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.755099  hitchhiker  0.0000148082 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1412  aspartate racemase family protein  28.3 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193401  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0370  aspartate racemase family protein  28.3 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000827408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2665  aspartate racemase family protein  23.47 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1897  aspartate racemase  29.75 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1521  aspartate racemase  28.3 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00121722  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0550  aspartate racemase  28.4 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3426  aspartate racemase  24.55 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3409  aspartate racemase  26.21 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>