168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1034 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1034  aspartate racemase  100 
 
 		 232 aa  476  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00115826  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1511  aspartate racemase  74.24 
 
 		 230 aa  365  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0452  aspartate racemase  51.12 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000396457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0308  aspartate racemase  37.61 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2004  aspartate racemase  35.06 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.272891  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2741  aspartate racemase  36.28 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4701  aspartate racemase  34.63 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0254125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2731  aspartate racemase  33.5 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3003  aspartate racemase  30.96 
 
 		 518 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.145787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3504  aspartate racemase  33.33 
 
 		 233 aa  131  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5944  aspartate racemase  31.62 
 
 		 489 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3987  aspartate racemase  33.33 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.191158 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5339  aspartate racemase  32.34 
 
 		 487 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302098  normal  0.0375198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1720  aspartate racemase  33.33 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.377946  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1302  aspartate racemase  35 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00152087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1090  aspartate racemase  31.56 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6217  aspartate racemase  32.16 
 
 		 484 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1263  aspartate racemase  31.72 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00631674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0629  aspartate racemase  36.1 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.578464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6736  aspartate racemase  35.71 
 
 		 497 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.973623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1378  aspartate racemase  32.46 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4865  aspartate racemase  31.56 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.629158  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4912  aspartate racemase  31.56 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal  0.107391 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4766  aspartate racemase  31.56 
 
 		 244 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.782175 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4841  aspartate racemase  31.56 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4914  aspartate racemase  31.56 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1731  aspartate racemase  33.19 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0565132  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1778  aspartate racemase  31.56 
 
 		 238 aa  118  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4295  aspartate racemase  32.31 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467897  normal  0.0102162 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2531  aspartate racemase  32.88 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5991  aspartate racemase  33.33 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5638  aspartate racemase  34.74 
 
 		 499 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4590  aspartate racemase  31.09 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0144088  normal  0.0378027 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1405  aspartate racemase  31.51 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1886  aspartate racemase  30.77 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0465  aspartate racemase  29.61 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1803  aspartate racemase  29.66 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3181  aspartate racemase  29.39 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1573  aspartate racemase  32.34 
 
 		 236 aa  105  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0521541  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4384  aspartate racemase  27.36 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0282  aspartate racemase  29.82 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3404  aspartate racemase  30.53 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.568997 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1048  aspartate racemase  28.95 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.688459  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2001  aspartate racemase  27.93 
 
 		 251 aa  92.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2418  aspartate racemase  27.85 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.790687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0071  aspartate racemase  28.15 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.937931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4736  aspartate racemase  27.57 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3108  aspartate racemase  28 
 
 		 259 aa  85.1  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1663  aspartate racemase  31.6 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.977225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2501  aspartate racemase  27.51 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00208009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2383  aspartate racemase  27.19 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1732  aspartate racemase  26.41 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000037531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2665  aspartate racemase family protein  27.19 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1547  aspartate racemase  26.61 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2706  aspartate racemase family protein  26.75 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2661  aspartate racemase family protein  26.32 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.561952  hitchhiker  0.0000201094 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4003  aspartate racemase  28.31 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000429712  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2031  aspartate racemase  25.11 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0604958 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2663  aspartate racemase family protein  25.44 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2656  aspartate racemase family protein  26.32 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000254701 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2459  aspartate racemase family protein  26.32 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0713108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2639  aspartate racemase family protein  26.32 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3685  aspartate racemase  29.02 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.209881 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0374  probable amino-acid racemase  25.42 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1877  aspartate racemase  24.12 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2422  aspartate racemase  25.88 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00910723  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4889  probable amino-acid racemase  26.18 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4503  aspartate racemase  24.03 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2497  aspartate racemase  25.52 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6429  aspartate racemase  25.42 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.390115 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4865  aspartate racemase family protein  24.46 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4485  aspartate racemase  24.03 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4873  probable amino-acid racemase  24.03 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3053  aspartate racemase  24.8 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0972  aspartate racemase  27.35 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2007  aspartate racemase  24.36 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2251  aspartate racemase family protein  24.36 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.85155e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4650  aspartate racemase family protein  24.68 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5005  aspartate racemase family protein  24.68 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1020  aspartate racemase  26.44 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03998  aspartate racemase  24.36 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2067  aspartate racemase family protein  25.94 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2223  aspartate racemase family protein  25.94 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0120  aspartate racemase, putative  24.66 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4583  aspartate racemase  24.67 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5934  aspartate racemase  25.43 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2143  aspartate racemase  25.43 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1222  aspartate racemase  23.61 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2006  aspartate racemase  24.79 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.975999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2599  aspartate racemase  22.98 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577714  normal  0.0780411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1262  aspartate racemase  25.65 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.399281  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000098  aspartate racemase  25.21 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.220289  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0080  aspartate racemase, putative  24.89 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0092  putative aspartate racemase  25.11 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0021  aspartate racemase  25.86 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4895  aspartate racemase family protein  23.58 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2098  aspartate racemase  27.35 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.817779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3426  aspartate racemase  22.92 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0941  aspartate racemase  25.53 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1412  aspartate racemase  26.25 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>