133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1020 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1020  aspartate racemase  100 
 
 		 238 aa  495  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0308  aspartate racemase  26.92 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2004  aspartate racemase  27.05 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.272891  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1803  aspartate racemase  26.64 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1090  aspartate racemase  29.17 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1302  aspartate racemase  26.69 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00152087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1378  aspartate racemase  26.85 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4873  probable amino-acid racemase  27.39 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4503  aspartate racemase  27.78 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1405  aspartate racemase  27.2 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1731  aspartate racemase  26.18 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0565132  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4295  aspartate racemase  24.29 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467897  normal  0.0102162 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4485  aspartate racemase  27.39 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3003  aspartate racemase  26.75 
 
 		 518 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.145787  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4650  aspartate racemase family protein  26.96 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5005  aspartate racemase family protein  26.96 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5339  aspartate racemase  30.67 
 
 		 487 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302098  normal  0.0375198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4841  aspartate racemase  28 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4914  aspartate racemase  28 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4766  aspartate racemase  28 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.782175 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1886  aspartate racemase  26.46 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4865  aspartate racemase family protein  26.52 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4889  probable amino-acid racemase  27.35 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4865  aspartate racemase  27.6 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.629158  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4912  aspartate racemase  27.6 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal  0.107391 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0629  aspartate racemase  25.42 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.578464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1778  aspartate racemase  25.12 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4590  aspartate racemase  24.76 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0144088  normal  0.0378027 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4583  aspartate racemase  27.04 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1263  aspartate racemase  25.24 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00631674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4895  aspartate racemase family protein  26.09 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5638  aspartate racemase  28.33 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4384  aspartate racemase  26.83 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5944  aspartate racemase  25.21 
 
 		 489 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1511  aspartate racemase  28.91 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0374  probable amino-acid racemase  25.75 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0465  aspartate racemase  25.57 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1573  aspartate racemase  24.79 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0521541  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2731  aspartate racemase  24.27 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6217  aspartate racemase  24.88 
 
 		 484 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1048  aspartate racemase  24.59 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.688459  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3108  aspartate racemase  25.73 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2741  aspartate racemase  24.89 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1034  aspartate racemase  26.44 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00115826  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1547  aspartate racemase  26.01 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2001  aspartate racemase  27.06 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3504  aspartate racemase  25.75 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0282  aspartate racemase  24.19 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3181  aspartate racemase  26.89 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3987  aspartate racemase  26.18 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.191158 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6429  aspartate racemase  23.92 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.390115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2793  aspartate racemase  22.79 
 
 		 230 aa  62  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0452  aspartate racemase  26.95 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000396457  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2199  aspartate/glutamate racemase family protein  23.15 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4701  aspartate racemase  26.67 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0254125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2098  aspartate racemase  26.26 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.817779 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1732  aspartate racemase  25 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000037531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1082  aspartate racemase  25.36 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1908  aspartate racemase  24.66 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6141  aspartate racemase  26.95 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.422237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0021  aspartate racemase  24.02 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3426  aspartate racemase  23.08 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1062  aspartate racemase  23.5 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301738  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2531  aspartate racemase  23.87 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6736  aspartate racemase  28.95 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.973623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3727  aspartate racemase  23.67 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0870  aspartate racemase  26.84 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0325955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1663  aspartate racemase  25.21 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.977225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4736  aspartate racemase  24.32 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000098  aspartate racemase  20.69 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.220289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4503  aspartate racemase  20.61 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3160  aspartate racemase  26.17 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000632506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0370  aspartate racemase family protein  24.88 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000827408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2497  aspartate racemase  21.5 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2599  aspartate racemase  22.32 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577714  normal  0.0780411 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4003  aspartate racemase  22.95 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000429712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3120  aspartate racemase family protein  23.22 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.755099  hitchhiker  0.0000148082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4593  aspartate racemase  21.26 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243748  normal  0.631 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5991  aspartate racemase  22.93 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0071  aspartate racemase  23.39 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.937931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1521  aspartate racemase  24.42 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00121722  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03998  aspartate racemase  20.26 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1222  aspartate racemase  24.3 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1530  aspartate racemase  22.08 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.204202 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2886  hypothetical protein  21.65 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1262  aspartate racemase  22.08 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.399281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1412  aspartate racemase family protein  24.41 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193401  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0972  aspartate racemase  23.83 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1171  aspartate racemase  25 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000110091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4755  aspartate racemase  22.99 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2663  aspartate racemase family protein  24.66 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4003  putative aspartate racemase  21.82 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3286  putative racemase  24.88 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.989342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0120  aspartate racemase, putative  20.67 
 
 		 231 aa  48.5  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2760  aspartate racemase  26.62 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458115  normal  0.682156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1897  aspartate racemase  20.74 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3409  aspartate racemase  25.56 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2501  aspartate racemase  22.6 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00208009  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2987  putative racemase  23.97 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1157  aspartate racemase  20.57 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>