21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1753 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1753  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 73 aa  150  7e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0545  XRE family transcriptional regulator  70 
 
 		 265 aa  84.7  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.360795  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0856  XRE family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 275 aa  77  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.609139  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  34.43 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2729  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 117 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 141 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05270  predicted transcriptional regulator  39.29 
 
 		 68 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3681  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 516 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  38.57 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  38.6 
 
 		 194 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  32.26 
 
 		 376 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2087  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 195 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>