97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10850 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_10850  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  100 
 
 		 187 aa  370  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00522306  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2295  protein of unknown function DUF177  54.35 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0450584  hitchhiker  0.00203125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11270  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  51.38 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2275  protein of unknown function DUF177  52.6 
 
 		 184 aa  175  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1607  protein of unknown function DUF177  50.27 
 
 		 192 aa  167  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0562637  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3282  hypothetical protein  45.3 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2170  hypothetical protein  47.22 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3435  protein of unknown function DUF177  45.7 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.756504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8019  protein of unknown function DUF177  47.8 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4193  hypothetical protein  46.07 
 
 		 196 aa  151  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.711363 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1668  protein of unknown function DUF177  48.24 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.323385  normal  0.0100711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2503  hypothetical protein  43.26 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911194  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0210  protein of unknown function DUF177  43.78 
 
 		 192 aa  147  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1948  hypothetical protein  44.51 
 
 		 189 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1994  hypothetical protein  44.51 
 
 		 189 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  0.358979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1928  hypothetical protein  44.51 
 
 		 189 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1284  hypothetical protein  45.41 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1566  protein of unknown function DUF177  43.75 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0425556  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1174  hypothetical protein  44.86 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7997  metal-binding possibly nucleic acid-binding protein-like protein  42.46 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3604  hypothetical protein  44.63 
 
 		 203 aa  140  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4031  protein of unknown function DUF177  44.25 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1136  hypothetical protein  44.25 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103256  normal  0.0238581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2120  hypothetical protein  40.22 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2782  hypothetical protein  40.96 
 
 		 184 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.161111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0649  hypothetical protein  44.81 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.865201  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2071  protein of unknown function DUF177  42.86 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.972003  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12941  hypothetical protein  40.78 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08880  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  43.33 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.486062  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1374  protein of unknown function DUF177  43.96 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131321  normal  0.107078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1881  protein of unknown function DUF177  40.83 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0908518  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5966  protein of unknown function DUF177  48.57 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1576  hypothetical protein  39.67 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0723626 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1039  putative metal-binding/nucleic acid-binding protein  34.72 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18370  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  39.88 
 
 		 198 aa  114  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0334  hypothetical protein  31.66 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09470  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  38.07 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0939  protein of unknown function DUF177  31.76 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000128856  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1843  hypothetical protein  26.37 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000297886  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0742  hypothetical protein  34.5 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1647  protein of unknown function DUF177  28.87 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2742  hypothetical protein  30.34 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0662187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0797  hypothetical protein  28.95 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0774  hypothetical protein  28.95 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000032907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1872  hypothetical protein  33.04 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000360622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1173  protein of unknown function DUF177  27.17 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000208772  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1976  hypothetical protein  30.82 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10040  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  34.48 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3111  protein of unknown function DUF177  33.07 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0474  hypothetical protein  29.29 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000014524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0835  hypothetical protein  30 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000635204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1151  protein of unknown function DUF177  32.28 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0769  metal-binding protein  31.62 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0636  hypothetical protein  32.19 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000112577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1433  hypothetical protein  26.24 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000012888  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2079  hypothetical protein  31.4 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4143  hypothetical protein  25.86 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.155219 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3825  protein of unknown function DUF177  26.52 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000165612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2612  hypothetical protein  32.09 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801895 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2845  protein of unknown function DUF177  30.43 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2937  protein of unknown function DUF177  30.43 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1358  protein of unknown function DUF177  30.41 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0534521  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1694  hypothetical protein  30.47 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2753  hypothetical protein  29.19 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0941  hypothetical protein  34.17 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1368  hypothetical protein  27.42 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000101542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1730  hypothetical protein  29.63 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000131873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3693  protein of unknown function DUF177  33.33 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10220  predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein  27.46 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.30799e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05650  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  31.43 
 
 		 140 aa  57  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00861555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1847  hypothetical protein  30.22 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1354  protein of unknown function DUF177  27.7 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000453474  normal  0.152935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1805  hypothetical protein  31.11 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1889  protein of unknown function DUF177  41.79 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1596  hypothetical protein  26.28 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.3780500000000002e-18  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0826  protein of unknown function DUF177  24.43 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0951  protein of unknown function DUF177  29.86 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000012525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1576  hypothetical protein  27.87 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000754833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2135  protein of unknown function DUF177  27.59 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000607383  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1328  hypothetical protein  27.04 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000416974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1258  protein of unknown function DUF177  29.13 
 
 		 173 aa  52  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000135148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1027  hypothetical protein  26.72 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000775006  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0856  protein of unknown function DUF177  28.82 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1512  protein of unknown function DUF177  32.33 
 
 		 173 aa  48.9  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3104  protein of unknown function DUF177  25.32 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203008 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0849  hypothetical protein  34.02 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2426  hypothetical protein  29.63 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00706179  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1411  protein of unknown function DUF177  30.15 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06081  metal-binding protein  25.85 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1739  hypothetical protein  23.88 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000472305  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1610  protein of unknown function DUF177  25.97 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00433257  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2989  protein of unknown function DUF177  29.79 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000169485  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1942  protein of unknown function DUF177  24.64 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000072056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1339  protein of unknown function DUF177  24.22 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.518128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1598  hypothetical protein  24.14 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0071  protein of unknown function DUF177  30.77 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2558  protein of unknown function DUF177  31.91 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>