105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2612 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2612  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1805  hypothetical protein  93.41 
 
 		 182 aa  345  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0742  hypothetical protein  46.02 
 
 		 178 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2989  protein of unknown function DUF177  46.24 
 
 		 177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000169485  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1647  protein of unknown function DUF177  38.46 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1085  metal-binding protein  32.89 
 
 		 147 aa  91.3  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1274  hypothetical protein  33.77 
 
 		 147 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000334048  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1057  hypothetical protein  34.97 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000225436  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2275  protein of unknown function DUF177  36.76 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3825  protein of unknown function DUF177  31.43 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000165612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0210  protein of unknown function DUF177  38.93 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1258  protein of unknown function DUF177  31.06 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000135148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1730  hypothetical protein  29.34 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000131873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1881  protein of unknown function DUF177  37.8 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0908518  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3282  hypothetical protein  36.15 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3435  protein of unknown function DUF177  38.57 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.756504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2426  hypothetical protein  28.98 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00706179  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1354  protein of unknown function DUF177  32.87 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000453474  normal  0.152935 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1668  protein of unknown function DUF177  36.54 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.323385  normal  0.0100711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1027  hypothetical protein  27.01 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000775006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0636  hypothetical protein  32.14 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000112577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8019  protein of unknown function DUF177  37.21 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0951  protein of unknown function DUF177  32.57 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000012525  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2079  hypothetical protein  26.86 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1433  hypothetical protein  32.86 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000012888  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1328  hypothetical protein  31.75 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000416974  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2742  hypothetical protein  34.04 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0662187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1610  protein of unknown function DUF177  30.61 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00433257  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2782  hypothetical protein  34.62 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.161111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2753  hypothetical protein  34.07 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2845  protein of unknown function DUF177  34.81 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0939  protein of unknown function DUF177  25.85 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000128856  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2937  protein of unknown function DUF177  34.81 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1607  protein of unknown function DUF177  32.54 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0562637  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1104  protein of unknown function DUF177  35.46 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000578932  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2503  hypothetical protein  33.57 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3104  protein of unknown function DUF177  34.84 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203008 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0649  hypothetical protein  35.97 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.865201  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1976  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1843  hypothetical protein  32.84 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000297886  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1039  putative metal-binding/nucleic acid-binding protein  31.55 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12941  hypothetical protein  36.03 
 
 		 207 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0826  protein of unknown function DUF177  29.51 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10220  predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein  27.04 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.30799e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7997  metal-binding possibly nucleic acid-binding protein-like protein  34.56 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1596  hypothetical protein  35.54 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.3780500000000002e-18  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3604  hypothetical protein  34.09 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1694  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1173  protein of unknown function DUF177  27.81 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000208772  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1598  hypothetical protein  47.27 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0769  metal-binding protein  27.83 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1739  hypothetical protein  42.19 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000472305  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3111  protein of unknown function DUF177  29.38 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1151  protein of unknown function DUF177  29.81 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1847  hypothetical protein  33.59 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5966  protein of unknown function DUF177  36.97 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08880  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  34.88 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.486062  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1284  hypothetical protein  31.62 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1942  protein of unknown function DUF177  30.3 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000072056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2120  hypothetical protein  29.23 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1174  hypothetical protein  31.62 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1576  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000754833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05650  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  31.58 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00861555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11270  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  34.06 
 
 		 191 aa  62  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0941  hypothetical protein  30.77 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1358  protein of unknown function DUF177  30.82 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0534521  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1339  protein of unknown function DUF177  35.19 
 
 		 167 aa  62  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.518128  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1411  protein of unknown function DUF177  28.74 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1136  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103256  normal  0.0238581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2295  protein of unknown function DUF177  33.83 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0450584  hitchhiker  0.00203125 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0334  hypothetical protein  33.11 
 
 		 209 aa  60.8  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10850  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  32.09 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00522306  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0071  protein of unknown function DUF177  36.75 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2071  protein of unknown function DUF177  33.33 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.972003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4143  hypothetical protein  32.35 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.155219 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10040  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  30.3 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1948  hypothetical protein  30.83 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1994  hypothetical protein  30.83 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  0.358979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1928  hypothetical protein  30.83 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1374  protein of unknown function DUF177  34.09 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131321  normal  0.107078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2170  hypothetical protein  31.16 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1872  hypothetical protein  31.36 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000360622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1889  protein of unknown function DUF177  40.85 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3693  protein of unknown function DUF177  30.81 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0856  protein of unknown function DUF177  29.2 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4031  protein of unknown function DUF177  31.75 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4193  hypothetical protein  31.54 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.711363 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2135  protein of unknown function DUF177  23.37 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000607383  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1512  protein of unknown function DUF177  33.93 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1368  hypothetical protein  36.67 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000101542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1576  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0723626 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2558  protein of unknown function DUF177  27.17 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18370  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  30.23 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0835  hypothetical protein  29.92 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000635204  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0774  hypothetical protein  29.63 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000032907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0797  hypothetical protein  29.63 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0849  hypothetical protein  27.43 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1566  protein of unknown function DUF177  30.89 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0425556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09470  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  35.54 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0339  hypothetical protein  30.37 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.834637  normal  0.0667006 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>