51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3773 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3773  Asp/Glu racemase  100 
 
 		 258 aa  518  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3570  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.62 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0732  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.9 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0887  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.68 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1394  Asp/Glu racemase  26.76 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7935  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.67 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.770582  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1038  Asp/Glu racemase  26.56 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.800252  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6044  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.68 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4918  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.89 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2142  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.62 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.112769 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3786  Asp/Glu racemase  28.95 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2514  Asp/Glu racemase  29.61 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.394743  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3942  maleate cis-trans isomerase  26.62 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783757  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3577  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.62 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1895  Asp/Glu racemase  26.62 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.929718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0631  Asp/Glu racemase  29.41 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6407  Asp/Glu racemase  29.05 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6640  Asp/Glu racemase  29.05 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4278  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.79 
 
 		 242 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3395  Asp/Glu racemase  26.48 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0652  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.11 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2309  Asp/Glu racemase  27.27 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.723097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2119  Asp/Glu racemase  27.45 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296834  normal  0.0170584 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5483  Asp/Glu racemase  28.22 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3050  Asp/Glu racemase  26.76 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4205  Asp/Glu racemase  30.26 
 
 		 252 aa  49.3  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7135  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.84 
 
 		 249 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.997188 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1639  Asp/Glu racemase  27.14 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.822276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4901  Asp/Glu racemase  27.27 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6238  Asp/Glu/hydantoin racemase  39.08 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1296  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.58 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal  0.0817455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4548  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.49 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383946  normal  0.990165 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3484  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.63 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.883286  hitchhiker  0.00122572 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4991  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.13 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4325  Asp/Glu racemase  27.63 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7410  arylmalonate decarboxylase  26.43 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4041  Asp/Glu racemase  27.63 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0733285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1385  Asp/Glu racemase  28.48 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1822  maleate cis-trans isomerase protein  28.95 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.119562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3672  maleate cis-trans isomerase  24.76 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3099  Asp/Glu racemase  27.92 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3928  Asp/Glu racemase  27.45 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45852  decreased coverage  0.00590655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1852  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.45 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1750  Asp/Glu racemase  26.17 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0733  putative Asp/Glu racemase  29.03 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.894763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4753  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.85 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1881  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.4 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.650539  normal  0.394704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0831  Asp/Glu racemase  26.35 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6615  Asp/Glu racemase  24.61 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4999  Asp/Glu racemase  23.81 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155445  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0214  putative cis-trans isomerase  26.14 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.018775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>