264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2733 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2733  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 
309 aa  642    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.605474  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2312  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  83.28 
 
 
316 aa  551  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0505  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.54 
 
 
307 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.659301  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1856  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.54 
 
 
307 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  83.55 
 
 
307 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.168802  normal  0.470834 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2404  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.28 
 
 
327 aa  513  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0305537  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0538  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.64 
 
 
316 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.142642  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2758  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.16 
 
 
313 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4370  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.1 
 
 
314 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1111  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69 
 
 
322 aa  441  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0521  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.9 
 
 
311 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0403  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.8 
 
 
308 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0463  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.1 
 
 
320 aa  438  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0951  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.3 
 
 
323 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0573  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.64 
 
 
311 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0412  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.8 
 
 
316 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.32208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0529  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.64 
 
 
311 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.919746  normal  0.728167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1140  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.9 
 
 
303 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3330  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.31 
 
 
310 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1979  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.23 
 
 
319 aa  435  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3419  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.21 
 
 
312 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3292  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.65 
 
 
312 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.449402  normal  0.533286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2355  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.87 
 
 
315 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3099  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.21 
 
 
312 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0281521  normal  0.928263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0713  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.17 
 
 
318 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217552  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.34 
 
 
316 aa  433  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1237  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.73 
 
 
314 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.33 
 
 
297 aa  428  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1093  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.28 
 
 
324 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4349  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69 
 
 
318 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528511  decreased coverage  0.00159485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1219  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.63 
 
 
320 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2587  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.21 
 
 
314 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.921846  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.88 
 
 
314 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357821  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1612  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67 
 
 
329 aa  418  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.119742 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2181  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4857  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.78 
 
 
291 aa  401  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2174  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.71 
 
 
302 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.122623  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2954  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.53 
 
 
295 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2112  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.64 
 
 
316 aa  394  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.178674  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2186  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.52 
 
 
301 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11020  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.75 
 
 
310 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.244614  hitchhiker  0.000000479429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1384  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.41 
 
 
320 aa  381  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00346477  normal  0.552148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0509  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.7 
 
 
322 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00315441  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.36 
 
 
317 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.47 
 
 
301 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552655 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1220  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.69 
 
 
304 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.02 
 
 
315 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000378016 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.64 
 
 
317 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.13 
 
 
301 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.8 
 
 
301 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.8 
 
 
301 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.02 
 
 
315 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  hitchhiker  0.000000000112208 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.13 
 
 
301 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.8 
 
 
301 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.13 
 
 
301 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000785129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.13 
 
 
301 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.02 
 
 
315 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000417626  normal  0.0864281 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0017  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.13 
 
 
301 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.8 
 
 
301 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0026  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.87 
 
 
301 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0127788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.07 
 
 
364 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.73 
 
 
308 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.64 
 
 
317 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.93 
 
 
287 aa  371  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.27 
 
 
309 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0080  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.69 
 
 
315 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352778  decreased coverage  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0184  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  59.67 
 
 
315 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.98 
 
 
287 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247076 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.34 
 
 
335 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.34 
 
 
329 aa  371  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.76 
 
 
327 aa  371  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.14 
 
 
314 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.7 
 
 
301 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.98 
 
 
312 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.68 
 
 
308 aa  371  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.74 
 
 
306 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2575  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  60.41 
 
 
314 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000932417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.36 
 
 
301 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.41 
 
 
301 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0111842  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0576  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.89 
 
 
295 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000614489  hitchhiker  0.0000000000000153639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.47 
 
 
301 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.98 
 
 
318 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.899304 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.86 
 
 
315 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1440  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.88 
 
 
321 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.02 
 
 
315 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1804  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.14 
 
 
301 aa  367  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1805  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.14 
 
 
301 aa  367  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.28 
 
 
317 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.86 
 
 
301 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0402  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.14 
 
 
328 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.41334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0417  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.14 
 
 
328 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1863  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.68 
 
 
294 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.02 
 
 
325 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.28 
 
 
323 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.53 
 
 
350 aa  371  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0448  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.9 
 
 
317 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.86 
 
 
301 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.28 
 
 
287 aa  367  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000278552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.02 
 
 
315 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4178  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.64 
 
 
314 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>