264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1612 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1612  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 
329 aa  685    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.119742 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2112  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.92 
 
 
316 aa  511  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.178674  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4857  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.97 
 
 
291 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0538  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.53 
 
 
316 aa  434  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.142642  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2954  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.38 
 
 
295 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0713  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.59 
 
 
318 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217552  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0529  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.97 
 
 
311 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.919746  normal  0.728167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0573  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.97 
 
 
311 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0951  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.35 
 
 
323 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1856  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.35 
 
 
307 aa  424  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1237  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.77 
 
 
314 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0505  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.01 
 
 
307 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.659301  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1093  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.89 
 
 
324 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1219  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.47 
 
 
320 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0521  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.92 
 
 
311 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0412  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.28 
 
 
316 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.32208  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0403  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.28 
 
 
308 aa  418  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3419  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.79 
 
 
312 aa  417  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2733  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.44 
 
 
309 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.605474  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2758  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.35 
 
 
313 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0463  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.94 
 
 
320 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.68 
 
 
307 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.168802  normal  0.470834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4370  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.78 
 
 
314 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3292  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.79 
 
 
312 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.449402  normal  0.533286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1140  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.6 
 
 
303 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2312  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.37 
 
 
316 aa  415  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3099  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.79 
 
 
312 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0281521  normal  0.928263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.07 
 
 
306 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2355  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.22 
 
 
315 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1220  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.28 
 
 
304 aa  412  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4349  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.46 
 
 
318 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528511  decreased coverage  0.00159485 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2181  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.93 
 
 
296 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1111  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.12 
 
 
322 aa  411  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.78 
 
 
316 aa  414  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2404  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.32 
 
 
327 aa  408  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0305537  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2587  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66 
 
 
314 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.921846  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.67 
 
 
314 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1979  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.44 
 
 
319 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.67 
 
 
314 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357821  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2174  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.19 
 
 
302 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.122623  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11020  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.96 
 
 
310 aa  404  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.244614  hitchhiker  0.000000479429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3330  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.86 
 
 
310 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2186  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.72 
 
 
301 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.32 
 
 
323 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.03 
 
 
317 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.03 
 
 
301 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.56 
 
 
315 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000378016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.07 
 
 
309 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.41 
 
 
329 aa  395  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.07 
 
 
317 aa  394  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0080  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.21 
 
 
315 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352778  decreased coverage  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.56 
 
 
315 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  hitchhiker  0.000000000112208 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.76 
 
 
350 aa  397  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.56 
 
 
315 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000417626  normal  0.0864281 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.69 
 
 
364 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0693  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.67 
 
 
304 aa  394  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.11795  hitchhiker  0.0000246007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0005  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.29 
 
 
311 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2115  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.07 
 
 
319 aa  391  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.160845  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1384  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.79 
 
 
320 aa  392  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00346477  normal  0.552148 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0788  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  63.41 
 
 
290 aa  393  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0493212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.76 
 
 
308 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.21 
 
 
301 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.86 
 
 
325 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0645  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.59 
 
 
312 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.86 
 
 
301 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.86 
 
 
315 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0208  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.07 
 
 
319 aa  391  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.86 
 
 
315 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1440  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.6 
 
 
321 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2575  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  64.91 
 
 
314 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000932417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.59 
 
 
318 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.899304 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.6 
 
 
301 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.94 
 
 
327 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2348  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.16 
 
 
312 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.29 
 
 
312 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.54 
 
 
296 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.59 
 
 
315 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2050  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  64.29 
 
 
308 aa  388  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19493  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.6 
 
 
301 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0111842  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.42 
 
 
297 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.6 
 
 
301 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000785129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.6 
 
 
301 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.6 
 
 
301 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0017  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.6 
 
 
301 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.94 
 
 
308 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0184  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  63.16 
 
 
315 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.16 
 
 
335 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.19 
 
 
317 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0216  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.24 
 
 
317 aa  384  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0389393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.11 
 
 
308 aa  385  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03831  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.54 
 
 
302 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.46 
 
 
301 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.89 
 
 
301 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.89 
 
 
301 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.89 
 
 
301 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0026  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.6 
 
 
301 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0127788 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.72 
 
 
317 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4178  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.94 
 
 
314 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.72 
 
 
317 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.89 
 
 
301 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>