264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2174 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2174  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 
302 aa  628  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.122623  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2181  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.49 
 
 
296 aa  418  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3099  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.23 
 
 
312 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0281521  normal  0.928263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1140  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
303 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3419  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.57 
 
 
312 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4857  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.51 
 
 
291 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3292  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.57 
 
 
312 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.449402  normal  0.533286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1111  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.76 
 
 
322 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0463  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.01 
 
 
320 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.28 
 
 
307 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.168802  normal  0.470834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4370  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.99 
 
 
314 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2312  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.63 
 
 
316 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0713  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67 
 
 
318 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0505  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.93 
 
 
307 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.659301  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0951  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.05 
 
 
323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0403  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.98 
 
 
308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2758  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.99 
 
 
313 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1856  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.61 
 
 
307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0412  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.98 
 
 
316 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.32208  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0573  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.33 
 
 
311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0538  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64 
 
 
316 aa  404  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.142642  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1979  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.7 
 
 
319 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0521  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.97 
 
 
311 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1612  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.41 
 
 
329 aa  401  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.119742 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1093  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.66 
 
 
324 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3330  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.83 
 
 
310 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2404  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.89 
 
 
327 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0305537  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0529  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.31 
 
 
311 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.919746  normal  0.728167 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1237  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.34 
 
 
314 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2733  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.71 
 
 
309 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.605474  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4349  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.75 
 
 
318 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528511  decreased coverage  0.00159485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1219  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.82 
 
 
320 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2355  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.21 
 
 
315 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.67 
 
 
314 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357821  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.46 
 
 
309 aa  388  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2587  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.97 
 
 
314 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.921846  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.1 
 
 
297 aa  387  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.95 
 
 
350 aa  388  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.86 
 
 
316 aa  387  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2186  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.16 
 
 
301 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.41 
 
 
325 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.79 
 
 
301 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.07 
 
 
308 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.73 
 
 
304 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4178  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.32 
 
 
314 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.63 
 
 
318 aa  381  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.899304 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.07 
 
 
329 aa  382  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.76 
 
 
301 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4168  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.04 
 
 
304 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.99 
 
 
301 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2954  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.99 
 
 
295 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2162  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.93 
 
 
328 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676955  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.45 
 
 
317 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.7 
 
 
309 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0216  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.67 
 
 
317 aa  381  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0389393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0417  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.46 
 
 
328 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0402  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.46 
 
 
328 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.41334 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.07 
 
 
317 aa  382  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0026  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.33 
 
 
301 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0127788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0069  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.7 
 
 
304 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.055597  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.76 
 
 
308 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.45 
 
 
317 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0042  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.38 
 
 
304 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03411  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
303 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0151  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  63.36 
 
 
303 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.96 
 
 
301 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2351  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.65 
 
 
392 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0526  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.86 
 
 
325 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.3 
 
 
301 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3783  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
304 aa  378  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3850  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.01 
 
 
303 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.4 
 
 
327 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0162  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.01 
 
 
303 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0882  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.65 
 
 
390 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0155  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
303 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3978  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.01 
 
 
303 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.805  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.3 
 
 
301 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3882  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
303 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.943552  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.28 
 
 
312 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4038  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.01 
 
 
303 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.300559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3869  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.01 
 
 
303 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2112  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.89 
 
 
316 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.178674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4131  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
304 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0645  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.94 
 
 
312 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3932  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.01 
 
 
303 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0022  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
304 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.535702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3965  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
303 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.51 
 
 
301 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3762  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
303 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.3 
 
 
301 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000785129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.3 
 
 
301 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4935  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
303 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.96 
 
 
301 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.96 
 
 
301 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.96 
 
 
301 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03362  hypothetical protein  63.36 
 
 
303 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1440  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.76 
 
 
321 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0017  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.3 
 
 
301 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4055  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
303 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0219  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.16 
 
 
335 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>