23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_21090 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_21090  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
447 aa  897    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1482  hypothetical protein  56.38 
 
 
447 aa  514  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000544917  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1665  methylaspartate mutase  51.61 
 
 
468 aa  435  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1816  methylaspartate mutase  47.44 
 
 
450 aa  432  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1171  putative component of D-ornithine aminomutase  48.79 
 
 
456 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333128  decreased coverage  0.0000285962 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0316  hypothetical protein  50.8 
 
 
455 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2691  glutamate mutase, MutL  39.78 
 
 
462 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15450  conserved hypothetical protein TIGR01319  38.81 
 
 
464 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000232195  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1024  hypothetical protein  37.96 
 
 
459 aa  270  5.9999999999999995e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000932144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1346  glutamate mutase, MutL  35.76 
 
 
461 aa  247  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4402  glutamate mutase, MutL  34.92 
 
 
460 aa  237  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2155  glutamate mutase, MutL  33.61 
 
 
471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.932369 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0831  putative glutamate mutase mutL  32.27 
 
 
462 aa  195  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0751  putative glutamate mutase mutL  33.59 
 
 
462 aa  193  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3947  glutamate mutase large subunit, B12-dependent  33.12 
 
 
454 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2387  hypothetical protein  32.37 
 
 
445 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030749  hitchhiker  0.000291133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2268  hypothetical protein  32.38 
 
 
469 aa  161  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00276621  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0781  hypothetical protein  29.21 
 
 
613 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0977  hypothetical protein  32.03 
 
 
443 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2439  hypothetical protein  21.89 
 
 
669 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0232795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2217  hypothetical protein  21.52 
 
 
676 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000677217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3650  hypothetical protein  26.96 
 
 
610 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0192  hypothetical protein  23.52 
 
 
725 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00309311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>