23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1816 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1816  methylaspartate mutase  100 
 
 
450 aa  907    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1665  methylaspartate mutase  62.14 
 
 
468 aa  586  1e-166  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0316  hypothetical protein  61.37 
 
 
455 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21090  DNA mismatch repair protein MutL  47.44 
 
 
447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1482  hypothetical protein  50.56 
 
 
447 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000544917  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1171  putative component of D-ornithine aminomutase  45.15 
 
 
456 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333128  decreased coverage  0.0000285962 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1346  glutamate mutase, MutL  38.44 
 
 
461 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2691  glutamate mutase, MutL  35.08 
 
 
462 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1024  hypothetical protein  35.53 
 
 
459 aa  263  6e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000932144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15450  conserved hypothetical protein TIGR01319  34.84 
 
 
464 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000232195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4402  glutamate mutase, MutL  33.55 
 
 
460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0751  putative glutamate mutase mutL  32.04 
 
 
462 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0831  putative glutamate mutase mutL  31.78 
 
 
462 aa  190  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2155  glutamate mutase, MutL  32.01 
 
 
471 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.932369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3947  glutamate mutase large subunit, B12-dependent  29.69 
 
 
454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0781  hypothetical protein  27.61 
 
 
613 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2387  hypothetical protein  26.28 
 
 
445 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030749  hitchhiker  0.000291133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2268  hypothetical protein  27 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00276621  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0977  hypothetical protein  28.54 
 
 
443 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3650  hypothetical protein  22.64 
 
 
610 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2439  hypothetical protein  19.38 
 
 
669 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0232795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2217  hypothetical protein  20.82 
 
 
676 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000677217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0192  hypothetical protein  22.3 
 
 
725 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00309311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>