19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2268 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2268  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  872    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00276621  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2387  hypothetical protein  89.21 
 
 		 445 aa  662    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030749  hitchhiker  0.000291133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3947  glutamate mutase large subunit, B12-dependent  55.03 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0977  hypothetical protein  51.97 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2691  glutamate mutase, MutL  35.76 
 
 		 462 aa  236  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15450  conserved hypothetical protein TIGR01319  34.33 
 
 		 464 aa  226  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000232195  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1024  hypothetical protein  30.9 
 
 		 459 aa  217  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000932144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4402  glutamate mutase, MutL  35.51 
 
 		 460 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1346  glutamate mutase, MutL  31.6 
 
 		 461 aa  192  9e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21090  DNA mismatch repair protein MutL  33.04 
 
 		 447 aa  186  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1482  hypothetical protein  31.65 
 
 		 447 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000544917  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1171  putative component of D-ornithine aminomutase  32 
 
 		 456 aa  172  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333128  decreased coverage  0.0000285962 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2155  glutamate mutase, MutL  31.5 
 
 		 471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.932369 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1665  methylaspartate mutase  30.43 
 
 		 468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0316  hypothetical protein  30.65 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0831  putative glutamate mutase mutL  32.2 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0751  putative glutamate mutase mutL  31.71 
 
 		 462 aa  152  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1816  methylaspartate mutase  27.5 
 
 		 450 aa  146  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0781  hypothetical protein  29.33 
 
 		 613 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>