22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4402 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4402  glutamate mutase, MutL  100 
 
 
460 aa  929    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2691  glutamate mutase, MutL  55.58 
 
 
462 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15450  conserved hypothetical protein TIGR01319  50.43 
 
 
464 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000232195  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1024  hypothetical protein  46.49 
 
 
459 aa  420  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000932144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1346  glutamate mutase, MutL  43.14 
 
 
461 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1482  hypothetical protein  35.96 
 
 
447 aa  266  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000544917  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21090  DNA mismatch repair protein MutL  34.92 
 
 
447 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1816  methylaspartate mutase  33.55 
 
 
450 aa  253  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1171  putative component of D-ornithine aminomutase  35.41 
 
 
456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333128  decreased coverage  0.0000285962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3947  glutamate mutase large subunit, B12-dependent  36.23 
 
 
454 aa  240  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1665  methylaspartate mutase  33.41 
 
 
468 aa  236  7e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0316  hypothetical protein  33.19 
 
 
455 aa  226  6e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0751  putative glutamate mutase mutL  34.84 
 
 
462 aa  222  9e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0831  putative glutamate mutase mutL  34.48 
 
 
462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2387  hypothetical protein  35.33 
 
 
445 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030749  hitchhiker  0.000291133 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2155  glutamate mutase, MutL  33.54 
 
 
471 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.932369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0977  hypothetical protein  35.64 
 
 
443 aa  195  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2268  hypothetical protein  36 
 
 
469 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00276621  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0781  hypothetical protein  29.88 
 
 
613 aa  143  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3650  hypothetical protein  22.42 
 
 
610 aa  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0192  hypothetical protein  21.61 
 
 
725 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00309311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2217  hypothetical protein  23.17 
 
 
676 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000677217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>