23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1665 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0316  hypothetical protein  74.38 
 
 		 455 aa  681    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1665  methylaspartate mutase  100 
 
 		 468 aa  955    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1816  methylaspartate mutase  62.14 
 
 		 450 aa  577  1.0000000000000001e-163  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1482  hypothetical protein  50.93 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000544917  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21090  DNA mismatch repair protein MutL  51.61 
 
 		 447 aa  435  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1171  putative component of D-ornithine aminomutase  48.74 
 
 		 456 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333128  decreased coverage  0.0000285962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2691  glutamate mutase, MutL  38.74 
 
 		 462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15450  conserved hypothetical protein TIGR01319  38.72 
 
 		 464 aa  266  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000232195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1346  glutamate mutase, MutL  37.33 
 
 		 461 aa  261  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1024  hypothetical protein  35.96 
 
 		 459 aa  254  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000932144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4402  glutamate mutase, MutL  33.41 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0751  putative glutamate mutase mutL  34.66 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0831  putative glutamate mutase mutL  34.92 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3947  glutamate mutase large subunit, B12-dependent  31 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2155  glutamate mutase, MutL  31.34 
 
 		 471 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.932369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2387  hypothetical protein  30.59 
 
 		 445 aa  150  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030749  hitchhiker  0.000291133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2268  hypothetical protein  30.23 
 
 		 469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00276621  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0781  hypothetical protein  31.75 
 
 		 613 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0977  hypothetical protein  30.83 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0192  hypothetical protein  26.76 
 
 		 725 aa  53.5  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00309311  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3650  hypothetical protein  26.55 
 
 		 610 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2439  hypothetical protein  23.81 
 
 		 669 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2217  hypothetical protein  21.81 
 
 		 676 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000677217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>