19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0751 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0751  putative glutamate mutase mutL  100 
 
 
462 aa  957    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0831  putative glutamate mutase mutL  98.05 
 
 
462 aa  942    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2691  glutamate mutase, MutL  36.03 
 
 
462 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1346  glutamate mutase, MutL  35.71 
 
 
461 aa  220  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1024  hypothetical protein  32.48 
 
 
459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000932144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15450  conserved hypothetical protein TIGR01319  35.37 
 
 
464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000232195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4402  glutamate mutase, MutL  34.84 
 
 
460 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21090  DNA mismatch repair protein MutL  33.59 
 
 
447 aa  193  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1665  methylaspartate mutase  34.66 
 
 
468 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1816  methylaspartate mutase  31.52 
 
 
450 aa  179  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1171  putative component of D-ornithine aminomutase  34.07 
 
 
456 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333128  decreased coverage  0.0000285962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1482  hypothetical protein  35.05 
 
 
447 aa  173  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000544917  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2155  glutamate mutase, MutL  32.54 
 
 
471 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.932369 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0316  hypothetical protein  31.38 
 
 
455 aa  167  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3947  glutamate mutase large subunit, B12-dependent  32.61 
 
 
454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0977  hypothetical protein  33.08 
 
 
443 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2387  hypothetical protein  30.86 
 
 
445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030749  hitchhiker  0.000291133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2268  hypothetical protein  31.46 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00276621  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0781  hypothetical protein  26.53 
 
 
613 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>