19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0977 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0977  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  842    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3947  glutamate mutase large subunit, B12-dependent  49.12 
 
 
454 aa  316  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2387  hypothetical protein  51.55 
 
 
445 aa  302  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030749  hitchhiker  0.000291133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2268  hypothetical protein  51.35 
 
 
469 aa  279  8e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00276621  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2691  glutamate mutase, MutL  36.56 
 
 
462 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4402  glutamate mutase, MutL  35.42 
 
 
460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15450  conserved hypothetical protein TIGR01319  33.33 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000232195  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1024  hypothetical protein  32.1 
 
 
459 aa  207  3e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000932144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1346  glutamate mutase, MutL  32.89 
 
 
461 aa  196  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1482  hypothetical protein  30.62 
 
 
447 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000544917  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21090  DNA mismatch repair protein MutL  32.03 
 
 
447 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1171  putative component of D-ornithine aminomutase  31.57 
 
 
456 aa  170  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333128  decreased coverage  0.0000285962 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2155  glutamate mutase, MutL  30.53 
 
 
471 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.932369 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1665  methylaspartate mutase  29.98 
 
 
468 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0831  putative glutamate mutase mutL  34.33 
 
 
462 aa  156  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0751  putative glutamate mutase mutL  33.83 
 
 
462 aa  153  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1816  methylaspartate mutase  27.72 
 
 
450 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0316  hypothetical protein  28.94 
 
 
455 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0781  hypothetical protein  27.78 
 
 
613 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>