21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3947 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3947  glutamate mutase large subunit, B12-dependent  100 
 
 
454 aa  875    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2387  hypothetical protein  55.48 
 
 
445 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030749  hitchhiker  0.000291133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2268  hypothetical protein  55.48 
 
 
469 aa  351  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00276621  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0977  hypothetical protein  48.68 
 
 
443 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2691  glutamate mutase, MutL  36.07 
 
 
462 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1024  hypothetical protein  33.33 
 
 
459 aa  230  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000932144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4402  glutamate mutase, MutL  36.23 
 
 
460 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15450  conserved hypothetical protein TIGR01319  34.9 
 
 
464 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000232195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1346  glutamate mutase, MutL  31.26 
 
 
461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1171  putative component of D-ornithine aminomutase  32.48 
 
 
456 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333128  decreased coverage  0.0000285962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1482  hypothetical protein  31.58 
 
 
447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000544917  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21090  DNA mismatch repair protein MutL  33.12 
 
 
447 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1665  methylaspartate mutase  31.94 
 
 
468 aa  176  9e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2155  glutamate mutase, MutL  32.49 
 
 
471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.932369 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0316  hypothetical protein  30.98 
 
 
455 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1816  methylaspartate mutase  29.91 
 
 
450 aa  161  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0751  putative glutamate mutase mutL  32.61 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0831  putative glutamate mutase mutL  32.85 
 
 
462 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0781  hypothetical protein  28.71 
 
 
613 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3650  hypothetical protein  27.81 
 
 
610 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0192  hypothetical protein  25.41 
 
 
725 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00309311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>