18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2439 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2439  hypothetical protein  100 
 
 		 669 aa  1325    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2217  hypothetical protein  73.34 
 
 		 676 aa  926    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000677217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3650  hypothetical protein  40.63 
 
 		 610 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0192  hypothetical protein  35.83 
 
 		 725 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00309311  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0781  hypothetical protein  30.94 
 
 		 613 aa  231  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0316  hypothetical protein  22.29 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21090  DNA mismatch repair protein MutL  23 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15450  conserved hypothetical protein TIGR01319  22.16 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000232195  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1482  hypothetical protein  21.25 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000544917  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1024  hypothetical protein  21.2 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000932144  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1816  methylaspartate mutase  21.57 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1665  methylaspartate mutase  22.11 
 
 		 468 aa  63.5  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1346  glutamate mutase, MutL  22.53 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1171  putative component of D-ornithine aminomutase  22.49 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333128  decreased coverage  0.0000285962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4402  glutamate mutase, MutL  24.51 
 
 		 460 aa  51.6  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2691  glutamate mutase, MutL  22.25 
 
 		 462 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2155  glutamate mutase, MutL  22.66 
 
 		 471 aa  44.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.932369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2268  hypothetical protein  24.23 
 
 		 469 aa  43.9  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00276621  normal  0.111523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>