16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2217 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2439  hypothetical protein  73.34 
 
 		 669 aa  909    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2217  hypothetical protein  100 
 
 		 676 aa  1349    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000677217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3650  hypothetical protein  40.98 
 
 		 610 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0192  hypothetical protein  36.85 
 
 		 725 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00309311  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0781  hypothetical protein  30.16 
 
 		 613 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21090  DNA mismatch repair protein MutL  21.52 
 
 		 447 aa  63.5  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0316  hypothetical protein  21.57 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1024  hypothetical protein  22.5 
 
 		 459 aa  62  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000932144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15450  conserved hypothetical protein TIGR01319  22.14 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000232195  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1482  hypothetical protein  21.12 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000544917  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1816  methylaspartate mutase  20.5 
 
 		 450 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1171  putative component of D-ornithine aminomutase  20.47 
 
 		 456 aa  56.6  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333128  decreased coverage  0.0000285962 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1665  methylaspartate mutase  21.81 
 
 		 468 aa  54.7  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3947  glutamate mutase large subunit, B12-dependent  25.97 
 
 		 454 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2155  glutamate mutase, MutL  21.46 
 
 		 471 aa  47  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.932369 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4402  glutamate mutase, MutL  23.08 
 
 		 460 aa  45.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>