36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08270 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_08270  nucleoside recognition domain protein  100 
 
 		 137 aa  259  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0111  nucleoside recognition domain protein  41.46 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0301213  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0184  nucleoside recognition domain protein  32.77 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2985  nucleoside recognition domain protein  28.36 
 
 		 312 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.371702  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1899  nucleoside recognition  37.9 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3717  nucleoside recognition domain-containing protein  36 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.180105 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3560  hypothetical protein  28.47 
 
 		 353 aa  67.8  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3169  nucleoside recognition domain protein  30.08 
 
 		 312 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0139  nucleoside recognition domain protein  29.08 
 
 		 327 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.209844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3415  nucleoside recognition domain-containing protein  31.34 
 
 		 330 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0127474 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2184  hypothetical protein  31.43 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3216  nucleoside recognition domain protein  33.85 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1395  hypothetical protein  30.15 
 
 		 316 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0326  nucleoside recognition  34.02 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4142  nucleoside recognition domain-containing protein  34.19 
 
 		 345 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1706  nucleoside recognition domain-containing protein  28.24 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0327666  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0325  nucleoside recognition domain protein  32.23 
 
 		 325 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0505  nucleoside recognition domain-containing protein  31.34 
 
 		 308 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4868  hypothetical protein  32.98 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.530849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4917  hypothetical protein  32.98 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4769  hypothetical protein  32.98 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4844  hypothetical protein  32.98 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4916  hypothetical protein  32.98 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.803574  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001111  membrane protein  45.24 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4928  hypothetical protein  32.98 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04160  hypothetical protein  32.98 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00590409  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4872  hypothetical protein  32.98 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5837  hypothetical protein  32.98 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.815259 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04198  conserved inner membrane protein  32.98 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00867395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3735  hypothetical protein  32.98 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00657888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4557  hypothetical protein  32.98 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04864  hypothetical protein  45.24 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0227  hypothetical protein  45.24 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2909  nucleoside recognition  33.9 
 
 		 437 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0621588 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3667  nucleoside recognition domain protein  32.98 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2631  hypothetical protein  37.04 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>