20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0325 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0325  nucleoside recognition domain protein  100 
 
 		 325 aa  638    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3216  nucleoside recognition domain protein  56.63 
 
 		 341 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3415  nucleoside recognition domain-containing protein  51.97 
 
 		 330 aa  306  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0127474 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0139  nucleoside recognition domain protein  49.67 
 
 		 327 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.209844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1706  nucleoside recognition domain-containing protein  49.19 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0327666  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2184  hypothetical protein  52.04 
 
 		 324 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3717  nucleoside recognition domain-containing protein  42.67 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.180105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1899  nucleoside recognition  44.19 
 
 		 322 aa  241  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4142  nucleoside recognition domain-containing protein  42.59 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3560  hypothetical protein  39.34 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1395  hypothetical protein  38.64 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85231  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2985  nucleoside recognition domain protein  25 
 
 		 312 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.371702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3169  nucleoside recognition domain protein  25.87 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0326  nucleoside recognition  29.82 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0185  nucleoside recognition domain protein  32.37 
 
 		 154 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0111  nucleoside recognition domain protein  35 
 
 		 143 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0301213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0110  nucleoside recognition domain protein  29.37 
 
 		 154 aa  57  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.350312  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0184  nucleoside recognition domain protein  35.45 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08270  nucleoside recognition domain protein  37.5 
 
 		 137 aa  53.1  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08280  nucleoside recognition domain protein  27.18 
 
 		 152 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>