20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3560 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3560  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  707    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3415  nucleoside recognition domain-containing protein  40.13 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0127474 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3216  nucleoside recognition domain protein  41.42 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0325  nucleoside recognition domain protein  40 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3717  nucleoside recognition domain-containing protein  39.93 
 
 		 325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.180105 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0139  nucleoside recognition domain protein  38.91 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.209844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1706  nucleoside recognition domain-containing protein  37.7 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0327666  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2184  hypothetical protein  39.02 
 
 		 324 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1395  hypothetical protein  37.07 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85231  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1899  nucleoside recognition  35.1 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4142  nucleoside recognition domain-containing protein  33.67 
 
 		 345 aa  173  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2985  nucleoside recognition domain protein  26.76 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.371702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3169  nucleoside recognition domain protein  25.08 
 
 		 312 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0326  nucleoside recognition  22.47 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08270  nucleoside recognition domain protein  31.58 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0185  nucleoside recognition domain protein  25.58 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08280  nucleoside recognition domain protein  36.71 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0111  nucleoside recognition domain protein  30 
 
 		 143 aa  53.1  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0301213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0110  nucleoside recognition domain protein  23.66 
 
 		 154 aa  50.1  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.350312  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0184  nucleoside recognition domain protein  28.69 
 
 		 148 aa  48.9  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>