20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0139 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0139  nucleoside recognition domain protein  100 
 
 		 327 aa  647    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.209844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1706  nucleoside recognition domain-containing protein  59.16 
 
 		 322 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0327666  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2184  hypothetical protein  58.36 
 
 		 324 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0325  nucleoside recognition domain protein  48.96 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3216  nucleoside recognition domain protein  48.11 
 
 		 341 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3415  nucleoside recognition domain-containing protein  42.52 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0127474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1395  hypothetical protein  40.07 
 
 		 316 aa  225  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3717  nucleoside recognition domain-containing protein  38.49 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.180105 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4142  nucleoside recognition domain-containing protein  40.55 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3560  hypothetical protein  38.91 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1899  nucleoside recognition  42.11 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2985  nucleoside recognition domain protein  24.92 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.371702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3169  nucleoside recognition domain protein  24.25 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0326  nucleoside recognition  27.51 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08270  nucleoside recognition domain protein  28.69 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0110  nucleoside recognition domain protein  29.6 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.350312  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0111  nucleoside recognition domain protein  34.78 
 
 		 143 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0301213  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0184  nucleoside recognition domain protein  31.4 
 
 		 148 aa  58.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0185  nucleoside recognition domain protein  32.14 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08280  nucleoside recognition domain protein  27.36 
 
 		 152 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>