20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1395 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1395  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  603  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3717  nucleoside recognition domain-containing protein  46.13 
 
 		 325 aa  258  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.180105 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3216  nucleoside recognition domain protein  40.65 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1706  nucleoside recognition domain-containing protein  39.26 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0327666  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0139  nucleoside recognition domain protein  40.07 
 
 		 327 aa  225  6e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.209844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3415  nucleoside recognition domain-containing protein  39 
 
 		 330 aa  222  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0127474 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0325  nucleoside recognition domain protein  39.29 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1899  nucleoside recognition  38.74 
 
 		 322 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2184  hypothetical protein  36.65 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3560  hypothetical protein  37.07 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4142  nucleoside recognition domain-containing protein  36.52 
 
 		 345 aa  175  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2985  nucleoside recognition domain protein  27.49 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.371702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0326  nucleoside recognition  26.34 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3169  nucleoside recognition domain protein  25.09 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0110  nucleoside recognition domain protein  32.81 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.350312  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0111  nucleoside recognition domain protein  33.03 
 
 		 143 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0301213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08270  nucleoside recognition domain protein  32.43 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0184  nucleoside recognition domain protein  29.73 
 
 		 148 aa  58.9  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0185  nucleoside recognition domain protein  28.8 
 
 		 154 aa  58.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08280  nucleoside recognition domain protein  29.69 
 
 		 152 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>