20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2184 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2184  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0139  nucleoside recognition domain protein  58.36 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.209844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1706  nucleoside recognition domain-containing protein  54.24 
 
 		 322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0327666  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0325  nucleoside recognition domain protein  52.04 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3216  nucleoside recognition domain protein  46.5 
 
 		 341 aa  279  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3415  nucleoside recognition domain-containing protein  41.82 
 
 		 330 aa  249  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0127474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3717  nucleoside recognition domain-containing protein  38.69 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.180105 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1395  hypothetical protein  36.22 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85231  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4142  nucleoside recognition domain-containing protein  40.61 
 
 		 345 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3560  hypothetical protein  38.78 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1899  nucleoside recognition  40.72 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2985  nucleoside recognition domain protein  25 
 
 		 312 aa  92.4  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.371702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0326  nucleoside recognition  27.92 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3169  nucleoside recognition domain protein  27 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0110  nucleoside recognition domain protein  29.41 
 
 		 154 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.350312  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0185  nucleoside recognition domain protein  32.14 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0184  nucleoside recognition domain protein  29.69 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0111  nucleoside recognition domain protein  30 
 
 		 143 aa  57  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0301213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08270  nucleoside recognition domain protein  31.43 
 
 		 137 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08280  nucleoside recognition domain protein  27.72 
 
 		 152 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>