35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0111 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0111  nucleoside recognition domain protein  100 
 
 
143 aa  282  9e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0301213  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0184  nucleoside recognition domain protein  50.78 
 
 
148 aa  125  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2985  nucleoside recognition domain protein  44.27 
 
 
312 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.371702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3169  nucleoside recognition domain protein  43.31 
 
 
312 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08270  nucleoside recognition domain protein  41.18 
 
 
137 aa  103  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0326  nucleoside recognition  43.59 
 
 
321 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3216  nucleoside recognition domain protein  37.19 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3415  nucleoside recognition domain-containing protein  35.77 
 
 
330 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0127474 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1706  nucleoside recognition domain-containing protein  34.15 
 
 
322 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0327666  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3717  nucleoside recognition domain-containing protein  35.11 
 
 
325 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.180105 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1395  hypothetical protein  33.62 
 
 
316 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85231  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1899  nucleoside recognition  34.43 
 
 
322 aa  63.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2184  hypothetical protein  29.79 
 
 
324 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0325  nucleoside recognition domain protein  33.88 
 
 
325 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0139  nucleoside recognition domain protein  33.33 
 
 
327 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.209844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3560  hypothetical protein  29.41 
 
 
353 aa  55.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4868  hypothetical protein  38.61 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.530849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4917  hypothetical protein  38.61 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4769  hypothetical protein  38.61 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4844  hypothetical protein  38.61 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4916  hypothetical protein  38.61 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.803574  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04160  hypothetical protein  37.62 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00590409  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4872  hypothetical protein  37.62 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5837  hypothetical protein  37.62 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.815259 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04198  conserved inner membrane protein  37.62 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00867395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3735  hypothetical protein  37.62 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00657888  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4928  hypothetical protein  37.62 
 
 
153 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4557  hypothetical protein  37.62 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3667  nucleoside recognition domain protein  37.62 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236098  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4142  nucleoside recognition domain-containing protein  27.42 
 
 
345 aa  48.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  28.57 
 
 
657 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0227  hypothetical protein  37.5 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001111  membrane protein  37.5 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271309  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04864  hypothetical protein  36.25 
 
 
155 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0779  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>