34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4557 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_04160  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  306  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00590409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5837  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  306  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.815259 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04198  conserved inner membrane protein  100 
 
 		 153 aa  306  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00867395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4872  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  306  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3735  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  306  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00657888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4557  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  306  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3667  nucleoside recognition domain protein  100 
 
 		 153 aa  306  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4928  hypothetical protein  99.35 
 
 		 153 aa  306  9e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4916  hypothetical protein  96.08 
 
 		 153 aa  298  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.803574  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4844  hypothetical protein  96.08 
 
 		 153 aa  298  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4769  hypothetical protein  96.08 
 
 		 153 aa  298  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4917  hypothetical protein  96.08 
 
 		 153 aa  298  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4868  hypothetical protein  96.08 
 
 		 153 aa  298  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.530849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0779  hypothetical protein  49.01 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906994 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0227  hypothetical protein  52.03 
 
 		 155 aa  153  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001111  membrane protein  51.35 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271309  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04864  hypothetical protein  50.68 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2631  hypothetical protein  46 
 
 		 157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1336  hypothetical protein  44.59 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0111  nucleoside recognition domain protein  37.62 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0301213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1355  nucleoside recognition  35.8 
 
 		 177 aa  48.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0626  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1646  nucleoside recognition domain protein  33.87 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0064  nucleoside recognition domain-containing protein  30.49 
 
 		 173 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000655497  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0346  nucleoside recognition domain-containing protein  29.67 
 
 		 179 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34329  normal  0.440444 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08270  nucleoside recognition domain protein  33.33 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0184  nucleoside recognition domain protein  32.32 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1293  nucleoside recognition domain protein  32.14 
 
 		 177 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0157  nucleoside recognition domain-containing protein  29.63 
 
 		 427 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0509  nucleoside recognition domain protein  31.91 
 
 		 459 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1060  nucleoside recognition domain-containing protein  31.71 
 
 		 440 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1073  small GTP-binding protein  29.73 
 
 		 650 aa  41.2  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3721  nucleoside recognition domain protein  43.75 
 
 		 419 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0225347  normal  0.0367959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>