27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04864 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04864  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  302  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001111  membrane protein  96.77 
 
 
155 aa  295  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271309  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0227  hypothetical protein  93.55 
 
 
155 aa  284  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0779  hypothetical protein  57.34 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2631  hypothetical protein  51.41 
 
 
157 aa  149  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3667  nucleoside recognition domain protein  50.68 
 
 
153 aa  148  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04160  hypothetical protein  50.68 
 
 
153 aa  148  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00590409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4557  hypothetical protein  50.68 
 
 
153 aa  148  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5837  hypothetical protein  50.68 
 
 
153 aa  148  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3735  hypothetical protein  50.68 
 
 
153 aa  148  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00657888  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4872  hypothetical protein  50.68 
 
 
153 aa  148  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04198  conserved inner membrane protein  50.68 
 
 
153 aa  148  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00867395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4928  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  147  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4868  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.530849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4916  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.803574  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4844  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4769  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4917  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1336  hypothetical protein  49.66 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2583  nucleoside recognition domain protein  32.58 
 
 
172 aa  44.3  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.225251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08270  nucleoside recognition domain protein  45.24 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0157  nucleoside recognition domain-containing protein  33.33 
 
 
427 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1355  nucleoside recognition  32.1 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0509  nucleoside recognition domain protein  32.29 
 
 
459 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2909  nucleoside recognition  33.77 
 
 
437 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0621588 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1293  nucleoside recognition domain protein  29.27 
 
 
177 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0111  nucleoside recognition domain protein  36.25 
 
 
143 aa  42  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0301213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>