32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0227 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0227  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  303  5.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001111  membrane protein  93.55 
 
 		 155 aa  285  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271309  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04864  hypothetical protein  93.55 
 
 		 155 aa  284  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0779  hypothetical protein  58.74 
 
 		 161 aa  173  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906994 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3667  nucleoside recognition domain protein  52.03 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04160  hypothetical protein  52.03 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00590409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5837  hypothetical protein  52.03 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4557  hypothetical protein  52.03 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04198  conserved inner membrane protein  52.03 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00867395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3735  hypothetical protein  52.03 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00657888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4872  hypothetical protein  52.03 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4868  hypothetical protein  51.35 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.530849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4916  hypothetical protein  51.35 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.803574  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4844  hypothetical protein  51.35 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4769  hypothetical protein  51.35 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4917  hypothetical protein  51.35 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4928  hypothetical protein  51.35 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1336  hypothetical protein  49.32 
 
 		 151 aa  146  9e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2631  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1355  nucleoside recognition  33.33 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08270  nucleoside recognition domain protein  45.24 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2583  nucleoside recognition domain protein  32.95 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.225251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0157  nucleoside recognition domain-containing protein  32.05 
 
 		 427 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0111  nucleoside recognition domain protein  37.5 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0301213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1293  nucleoside recognition domain protein  30.86 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0509  nucleoside recognition domain protein  32.29 
 
 		 459 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2909  nucleoside recognition  32.47 
 
 		 437 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0621588 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  29.13 
 
 		 663 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  29.22 
 
 		 662 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  29.92 
 
 		 663 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0609  hypothetical protein  34.38 
 
 		 177 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0626  hypothetical protein  34.38 
 
 		 177 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>