98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2583 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2583  nucleoside recognition domain protein  100 
 
 
172 aa  326  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.225251  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0609  hypothetical protein  35.12 
 
 
177 aa  127  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0626  hypothetical protein  35.12 
 
 
177 aa  127  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0157  nucleoside recognition domain-containing protein  33.33 
 
 
427 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1197  nucleoside recognition domain-containing protein  34.12 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.966368  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1731  nucleoside recognition domain protein  31.61 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2909  nucleoside recognition  32.75 
 
 
437 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0621588 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1646  nucleoside recognition domain protein  33.97 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1252  nucleoside recognition domain protein  35.29 
 
 
180 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2098  nucleoside recognition  36.71 
 
 
177 aa  111  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000183631  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1141  nucleoside recognition domain-containing protein  34.91 
 
 
176 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3987  spore maturation protein B  38.51 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000757756 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0064  nucleoside recognition domain-containing protein  37.16 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000655497  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1293  nucleoside recognition domain protein  37.93 
 
 
177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3198  nucleoside recognition  34.59 
 
 
414 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000170625  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1060  nucleoside recognition domain-containing protein  31.45 
 
 
440 aa  107  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1412  nucleoside recognition proteinn  33.12 
 
 
178 aa  106  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0809763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1355  nucleoside recognition  30.54 
 
 
177 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2094  nucleoside recognition domain protein  34.12 
 
 
176 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3721  nucleoside recognition domain protein  35.03 
 
 
419 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0225347  normal  0.0367959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3902  spore maturation protein B  37.84 
 
 
176 aa  104  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2541  spore maturation protein B  36.49 
 
 
172 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1045  hypothetical protein  30.57 
 
 
412 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2856  spore maturation protein B  35.81 
 
 
172 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1394  nucleoside recognition domain-containing protein  31.65 
 
 
176 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0166  nucleoside recognition domain protein  36.31 
 
 
176 aa  102  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00262141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11840  nucleoside recognition domain protein  31.93 
 
 
176 aa  101  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.456869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3414  nucleoside recognition domain protein  32.67 
 
 
179 aa  100  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0509  nucleoside recognition domain protein  31.54 
 
 
459 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3694  nucleoside recognition domain-containing protein  35.57 
 
 
419 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1492  spore maturation protein  31.65 
 
 
176 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1596  spore maturation protein  31.65 
 
 
176 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0397  nucleoside recognition domain protein  32.73 
 
 
177 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1353  spore maturation protein B  31.65 
 
 
176 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.727797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1632  spore maturation protein  31.65 
 
 
176 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1354  spore maturation protein B  31.65 
 
 
176 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1381  spore maturation protein  31.65 
 
 
176 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.787008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1564  spore maturation protein  31.65 
 
 
176 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000627549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1526  spore maturation protein  31.65 
 
 
176 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3819  spore maturation protein  31.65 
 
 
176 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000206077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3343  nucleoside recognition  32.24 
 
 
414 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000052654  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1195  nucleoside recognition domain-containing protein  31.65 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3256  nucleoside recognition  34.64 
 
 
414 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0327  nucleoside recognition domain protein  34.15 
 
 
415 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0342  nucleoside recognition domain protein  33.54 
 
 
415 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.615093  normal  0.386268 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1273  nucleoside recognition domain-containing protein  30.72 
 
 
432 aa  99  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.944604  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0452  putative transmembrane protein  33.74 
 
 
415 aa  99  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2038  spore maturation protein A-related protein  31.01 
 
 
408 aa  98.2  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2165  spore maturation-related protein  34.27 
 
 
476 aa  98.2  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2607  spore maturation protein A-related protein  31.69 
 
 
408 aa  97.8  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4460  nucleoside recognition domain protein  32.26 
 
 
411 aa  97.1  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0511  spore maturation protein A/spore maturation protein B  32.12 
 
 
410 aa  96.7  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2643  nucleoside recognition domain-containing protein  35.29 
 
 
408 aa  97.1  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0603186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1666  nucleoside recognition domain-containing protein  31.69 
 
 
408 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1741  nucleoside recognition domain-containing protein  31.69 
 
 
408 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1771  nucleoside recognition domain-containing protein  31.69 
 
 
408 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.253626  normal  0.260511 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3907  nucleoside recognition domain-containing protein  36.42 
 
 
174 aa  95.5  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00390  hypothetical protein  29.75 
 
 
409 aa  95.1  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2224  nucleoside recognition domain protein  32.05 
 
 
177 aa  95.1  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2209  nucleoside recognition domain-containing protein  31.82 
 
 
408 aa  94.4  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.609992  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2447  nucleoside recognition domain-containing protein  31.82 
 
 
408 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2454  nucleoside recognition domain-containing protein  31.82 
 
 
408 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1897  nucleoside recognition domain protein  31.82 
 
 
408 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2567  nucleoside recognition domain-containing protein  31.82 
 
 
408 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154533  normal  0.0459747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6276  hypothetical protein  28.48 
 
 
409 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72320  hypothetical protein  31.48 
 
 
409 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5089  nucleoside recognition domain-containing protein  30.32 
 
 
409 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.394675  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0346  nucleoside recognition domain-containing protein  30.71 
 
 
179 aa  91.7  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34329  normal  0.440444 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2235  nucleoside recognition domain-containing protein  31.69 
 
 
412 aa  91.3  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0156  nucleoside recognition domain-containing protein  29.19 
 
 
409 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0138  nucleoside recognition domain protein  29.56 
 
 
409 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.684841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0012  nucleoside recognition domain-containing protein  29.8 
 
 
417 aa  90.5  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.972428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0121  hypothetical protein  30.86 
 
 
413 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0706  nucleoside recognition domain protein  38.51 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3506  nucleoside recognition domain-containing protein  32.19 
 
 
409 aa  90.5  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.848291  normal  0.806828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0879  nucleoside recognition domain-containing protein  37.24 
 
 
479 aa  90.5  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1928  nucleoside recognition domain-containing protein  34.19 
 
 
408 aa  89.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269289  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0154  nucleoside recognition domain-containing protein  30.32 
 
 
409 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.72352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0141  nucleoside recognition domain protein  29.3 
 
 
409 aa  89.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.375591  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0030  nucleoside recognition domain protein  29.14 
 
 
417 aa  89  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0066  bifunctional spore maturation protein, fused SpmA/SpmB  30.25 
 
 
413 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2045  nucleoside recognition  30.41 
 
 
412 aa  88.6  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2590  nucleoside recognition domain protein  32.61 
 
 
423 aa  87.8  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204339  normal  0.0892212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1987  nucleoside recognition domain-containing protein  35.06 
 
 
408 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0078  nucleoside recognition domain-containing protein  31.01 
 
 
409 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2867  nucleoside recognition domain protein  32.37 
 
 
411 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0752629 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4077  nucleoside recognition  31.29 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.343948  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4201  nucleoside recognition domain protein  31.25 
 
 
180 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4226  nucleoside recognition domain protein  31.25 
 
 
180 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1584  nucleoside recognition domain-containing protein  31.82 
 
 
408 aa  84.7  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.407831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0041  nucleoside recognition  29.3 
 
 
409 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672164  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0719  putative spore maturation protein A/B  29.71 
 
 
409 aa  84  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0026  nucleoside recognition domain-containing protein  27.63 
 
 
417 aa  80.9  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0779  hypothetical protein  28.89 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906994 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001111  membrane protein  27.33 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271309  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04864  hypothetical protein  32.58 
 
 
155 aa  44.3  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2631  hypothetical protein  28.57 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0227  hypothetical protein  32.95 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>