49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6572 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6572  peptidase M19 renal dipeptidase  100 
 
 
667 aa  1386    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.595868  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0641  hypothetical protein  27.48 
 
 
676 aa  110  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.64 
 
 
695 aa  98.2  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3371  hypothetical protein  25.97 
 
 
477 aa  94  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.330368  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4403  hypothetical protein  27.14 
 
 
809 aa  79  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0845  peptidase M19 renal dipeptidase  22.63 
 
 
390 aa  61.6  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.773406  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  27.55 
 
 
345 aa  58.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  27.78 
 
 
345 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  25.6 
 
 
328 aa  55.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  26.03 
 
 
327 aa  55.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  33.78 
 
 
352 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  26.13 
 
 
394 aa  53.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  27.86 
 
 
415 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  25 
 
 
323 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  26.23 
 
 
349 aa  51.6  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  26.23 
 
 
349 aa  51.6  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  26.99 
 
 
312 aa  51.2  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  23.93 
 
 
315 aa  51.2  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  28.67 
 
 
311 aa  51.2  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  26.63 
 
 
397 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  31.41 
 
 
307 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  27.02 
 
 
353 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  24.42 
 
 
323 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  28.25 
 
 
402 aa  50.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  27.63 
 
 
333 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  25 
 
 
359 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  31.25 
 
 
307 aa  48.5  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  22.06 
 
 
433 aa  48.5  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  28.14 
 
 
223 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  30.77 
 
 
306 aa  47.8  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  24.03 
 
 
311 aa  47.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  23.32 
 
 
315 aa  47  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.06 
 
 
438 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  27.59 
 
 
444 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  29.17 
 
 
390 aa  47  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  25.37 
 
 
387 aa  47.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  25.52 
 
 
346 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  23.03 
 
 
402 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  29.81 
 
 
332 aa  46.6  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  31.76 
 
 
352 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  25.1 
 
 
400 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  25.56 
 
 
323 aa  45.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  28.19 
 
 
346 aa  45.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  28.19 
 
 
346 aa  45.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  35.29 
 
 
420 aa  44.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  24.38 
 
 
323 aa  44.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  26.11 
 
 
317 aa  44.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  24.58 
 
 
439 aa  43.9  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  34.09 
 
 
326 aa  43.9  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>