205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5050 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5050  integrase catalytic region  100 
 
 		 435 aa  891    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5023  integrase catalytic region  60.63 
 
 		 292 aa  353  4e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5025  hypothetical protein  65.89 
 
 		 140 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5272  hypothetical protein  65.12 
 
 		 145 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5020  hypothetical protein  65.31 
 
 		 62 aa  70.1  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435408  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0088  Integrase catalytic region  27.46 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1352  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1394  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0489416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2305  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3181  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.299267  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  26.88 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3500  hypothetical protein  27.76 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000943241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1990  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0292285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1071  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000428907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0711  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000332452  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3369  TROVE domain protein  27.05 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3325  hypothetical protein  27.05 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3517  hypothetical protein  27.05 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3104  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1366  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000904408  decreased coverage  0.0000712993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0721  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208316  decreased coverage  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3080  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  27.13 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2064  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1853  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1564  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2485  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2429  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2714  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  0.786621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2691  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2732  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2719  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00913617  normal  0.77965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2762  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3016  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2964  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3091  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0527  Integrase catalytic region  29.29 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0006  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000397696  normal  0.219937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0896  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.366884  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1690  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1497  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  hitchhiker  0.000449962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1541  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000437148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2869  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.513593  normal  0.876471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0375  Integrase catalytic region  27.13 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0945a  transposase  24.38 
 
 		 276 aa  55.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2602  integrase catalytic subunit  27.52 
 
 		 282 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.323138 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  26.25 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  26.17 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1236  Integrase catalytic region  25.5 
 
 		 270 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  33.33 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  26.17 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  26.96 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  26.17 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1289  Integrase catalytic region  25.5 
 
 		 270 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2192  Integrase catalytic region  25.5 
 
 		 270 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1834  integrase catalytic subunit  25.64 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  29.41 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  26.17 
 
 		 262 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  26.17 
 
 		 262 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  23.86 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  23.86 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  23.86 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  23.86 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  23.86 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  23.86 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  23.86 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  23.86 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  23.86 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  25.7 
 
 		 597 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  25.44 
 
 		 383 aa  51.2  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1842  integrase catalytic subunit  25.64 
 
 		 387 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1693  integrase catalytic subunit  25.2 
 
 		 167 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.271458  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  26.88 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  26.88 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3989  IS3 family transposase  23.62 
 
 		 165 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  26.88 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  25.49 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  25.49 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1778  integrase catalytic subunit  24.39 
 
 		 426 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.12662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>