42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2682 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2682  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  252  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0068  hypothetical protein  43.48 
 
 
116 aa  103  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0478326  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3877  hypothetical protein  36.54 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00430836  normal  0.195451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0165  hypothetical protein  35.92 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3024  hypothetical protein  36 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3537  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0390  hypothetical protein  32.48 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0389  hypothetical protein  26.45 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.317386 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4503  hypothetical protein  33.64 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0027  hypothetical protein  39.71 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431177  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0908  protein of unknown function DUF983  51.22 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2417  hypothetical protein  42.86 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.000693417  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1714  hypothetical protein  34.25 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671018  normal  0.409198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0415  hypothetical protein  46.94 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363772  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3035  hypothetical protein  42.86 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0408489  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3581  protein of unknown function DUF983  36.76 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2237  hypothetical protein  45 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.483595  normal  0.0351044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3257  hypothetical protein  36.76 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0865368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4735  hypothetical protein  45.95 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3453  protein of unknown function DUF983  39.68 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.412881  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01710  hypothetical protein  24.07 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0608198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2343  hypothetical protein  42.11 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.76851  normal  0.642219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1055  protein of unknown function DUF983  45.24 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0431012  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0266  protein of unknown function DUF983  43.86 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.550192  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0418  hypothetical protein  30.61 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6977  protein of unknown function DUF983  31.82 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.906063  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2439  hypothetical protein  31.51 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0760053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1352  hypothetical protein  43.75 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27643  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2074  hypothetical protein  30.61 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0271122  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3673  hypothetical protein  37.04 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0930  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.849799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7104  hypothetical protein  32.08 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5680  hypothetical protein  30.28 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.287697  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0606  hypothetical protein  38.89 
 
 
153 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0571  hypothetical protein  38.89 
 
 
153 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2074  hypothetical protein  35.59 
 
 
141 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.148673  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1611  hypothetical protein  45 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991152  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1973  hypothetical protein  45.24 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2765  hypothetical protein  51.52 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.934534  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2338  protein of unknown function DUF983  48.65 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2179  hypothetical protein  38.89 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0449499  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2342  hypothetical protein  28.57 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000430301  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>