21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5680 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5680  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.287697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0323  hypothetical protein  42.97 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1850  hypothetical protein  39.17 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00373006  normal  0.150652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1648  hypothetical protein  34.4 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.563063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01710  hypothetical protein  37.17 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0608198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0389  hypothetical protein  37.39 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.317386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1731  hypothetical protein  36.45 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0999577  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1859  hypothetical protein  35.65 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0713511  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4454  hypothetical protein  37.39 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7104  hypothetical protein  35.96 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2391  hypothetical protein  33.04 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.469176  normal  0.286577 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1011  hypothetical protein  30.97 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4455  hypothetical protein  30.83 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3877  hypothetical protein  29.09 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00430836  normal  0.195451 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3252  hypothetical protein  32.76 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.744419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11838  hypothetical protein  32.81 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0266  protein of unknown function DUF983  29.57 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.550192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0165  hypothetical protein  29.2 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3291  hypothetical protein  29.13 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2682  hypothetical protein  30.28 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2343  hypothetical protein  26.96 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.76851  normal  0.642219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>