17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7104 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7104  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  289  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2391  hypothetical protein  59.09 
 
 		 143 aa  163  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.469176  normal  0.286577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1859  hypothetical protein  38.46 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0713511  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4454  hypothetical protein  38.76 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3252  hypothetical protein  39.2 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.744419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01710  hypothetical protein  34.4 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0608198  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0323  hypothetical protein  34.59 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0389  hypothetical protein  38.02 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.317386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1731  hypothetical protein  35.77 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0999577  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1011  hypothetical protein  37.19 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1648  hypothetical protein  35.04 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.563063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5680  hypothetical protein  35.96 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.287697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1850  hypothetical protein  31.93 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00373006  normal  0.150652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4455  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2682  hypothetical protein  32.08 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0165  hypothetical protein  35.62 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3877  hypothetical protein  30.56 
 
 		 117 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00430836  normal  0.195451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>