13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3877 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3877  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  234  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00430836  normal  0.195451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0165  hypothetical protein  85.47 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2682  hypothetical protein  36.54 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0068  hypothetical protein  32.67 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0478326  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3252  hypothetical protein  25 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.744419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5680  hypothetical protein  29.09 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.287697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3024  hypothetical protein  27.47 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2391  hypothetical protein  40.68 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.469176  normal  0.286577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7104  hypothetical protein  30.56 
 
 		 137 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3844  protein of unknown function DUF983  24.75 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0754377 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4734  protein of unknown function DUF983  36.25 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1249  protein of unknown function DUF983  26.79 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4601  transcriptional regulator, LysR family  44.07 
 
 		 301 aa  40  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.685719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>