57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0068 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0068  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  233  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0478326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2682  hypothetical protein  43.48 
 
 
126 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0165  hypothetical protein  33.66 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3877  hypothetical protein  32.67 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00430836  normal  0.195451 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0390  hypothetical protein  31.58 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0587  hypothetical protein  25.22 
 
 
131 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.017099  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2439  hypothetical protein  54.05 
 
 
146 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0760053  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3673  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3981  hypothetical protein  42.37 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881431  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0563  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3573  hypothetical protein  26.67 
 
 
154 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.717578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0027  hypothetical protein  26.47 
 
 
124 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431177  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2417  hypothetical protein  54.29 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.000693417  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1352  hypothetical protein  59.38 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27643  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3863  hypothetical protein  56.25 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1293  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2338  protein of unknown function DUF983  47.22 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4500  hypothetical protein  30.43 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4793  hypothetical protein  30.77 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1249  protein of unknown function DUF983  37.88 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3453  protein of unknown function DUF983  50 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.412881  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3035  hypothetical protein  51.43 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0408489  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1385  hypothetical protein  38.18 
 
 
151 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497809  normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3844  protein of unknown function DUF983  50 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0754377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6673  hypothetical protein  51.52 
 
 
170 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975454  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0606  hypothetical protein  32.26 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0571  hypothetical protein  32.26 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0473  hypothetical protein  28.71 
 
 
127 aa  43.5  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1714  hypothetical protein  48.57 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671018  normal  0.409198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0389  hypothetical protein  24.58 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.317386 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  26.32 
 
 
439 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2381  hypothetical protein  44.44 
 
 
165 aa  42.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2658  protein of unknown function DUF983  44.44 
 
 
165 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4735  hypothetical protein  45.71 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2179  hypothetical protein  50 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0449499  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3537  hypothetical protein  45.71 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4642  hypothetical protein  38.46 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242788  normal  0.0997926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1055  protein of unknown function DUF983  28.57 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0431012  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2237  hypothetical protein  45.45 
 
 
149 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.483595  normal  0.0351044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0908  protein of unknown function DUF983  30.16 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0261  hypothetical protein  28.57 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3457  hypothetical protein  28.57 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.85085  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1859  hypothetical protein  21.74 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0713511  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0525  hypothetical protein  24.37 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150088  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0415  hypothetical protein  50 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363772  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0724  hypothetical protein  42.86 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3291  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3257  hypothetical protein  44.12 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0865368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3581  protein of unknown function DUF983  44.12 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2343  hypothetical protein  42.42 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.76851  normal  0.642219 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0930  hypothetical protein  40.38 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.849799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0767  hypothetical protein  44.44 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12977  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0266  protein of unknown function DUF983  42.42 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.550192  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1046  hypothetical protein  41.67 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52629  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1754  hypothetical protein  37.04 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1611  hypothetical protein  48.48 
 
 
137 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4503  hypothetical protein  26.47 
 
 
137 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.22274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>