84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1611 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1611  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991152  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1973  hypothetical protein  75.19 
 
 
139 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1055  protein of unknown function DUF983  76.03 
 
 
122 aa  202  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0431012  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0908  protein of unknown function DUF983  74.38 
 
 
122 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1558  protein of unknown function DUF983  71.54 
 
 
130 aa  197  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.602074  normal  0.0157873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0415  hypothetical protein  69.49 
 
 
162 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363772  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2765  hypothetical protein  59.2 
 
 
147 aa  164  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.934534  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2074  hypothetical protein  60.87 
 
 
141 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.148673  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4734  protein of unknown function DUF983  57.76 
 
 
128 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4739  protein of unknown function DUF983  53.97 
 
 
143 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0123069 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6977  protein of unknown function DUF983  57.63 
 
 
128 aa  146  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.906063  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3291  hypothetical protein  54.84 
 
 
135 aa  144  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4222  hypothetical protein  54.78 
 
 
168 aa  144  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.867791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4592  protein of unknown function DUF983  50 
 
 
147 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0893278 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0563  hypothetical protein  53.85 
 
 
147 aa  135  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0027  hypothetical protein  51.67 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431177  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2343  hypothetical protein  48.36 
 
 
122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.76851  normal  0.642219 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2484  hypothetical protein  52.89 
 
 
132 aa  124  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159149  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0266  protein of unknown function DUF983  49.56 
 
 
122 aa  124  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.550192  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1249  protein of unknown function DUF983  53.91 
 
 
125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0724  hypothetical protein  48.74 
 
 
127 aa  123  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6945  protein of unknown function DUF983  55.74 
 
 
134 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3581  protein of unknown function DUF983  46.34 
 
 
124 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3257  hypothetical protein  46.34 
 
 
124 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0865368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0674  hypothetical protein  51.33 
 
 
128 aa  120  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.722288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4793  hypothetical protein  47.24 
 
 
133 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3453  protein of unknown function DUF983  46.34 
 
 
124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.412881  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4642  hypothetical protein  48.03 
 
 
128 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242788  normal  0.0997926 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  45.24 
 
 
439 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0609  protein of unknown function DUF983  45.24 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0473  hypothetical protein  44.44 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0649  protein of unknown function DUF983  44.44 
 
 
126 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.643544  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4582  hypothetical protein  45.31 
 
 
132 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3457  hypothetical protein  48.18 
 
 
129 aa  110  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.85085  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0261  hypothetical protein  48.18 
 
 
129 aa  110  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0820  hypothetical protein  43.94 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0587  hypothetical protein  43.9 
 
 
131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.017099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0525  hypothetical protein  40.94 
 
 
127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150088  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2228  hypothetical protein  44.25 
 
 
119 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519289  normal  0.0128796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1046  hypothetical protein  37.6 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0834  hypothetical protein  45.6 
 
 
129 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0767  hypothetical protein  45.9 
 
 
130 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12977  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0905  protein of unknown function DUF983  49.07 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4735  hypothetical protein  40.52 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4500  hypothetical protein  39.64 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2417  hypothetical protein  37.61 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.000693417  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2237  hypothetical protein  36.7 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.483595  normal  0.0351044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3035  hypothetical protein  36.75 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0408489  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3537  hypothetical protein  39.22 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1400  hypothetical protein  35.92 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3573  hypothetical protein  36.27 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.717578 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3673  hypothetical protein  36.63 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2439  hypothetical protein  39.22 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0760053  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2338  protein of unknown function DUF983  34.62 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2381  hypothetical protein  33.64 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3881  hypothetical protein  38.53 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868081  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2658  protein of unknown function DUF983  33.64 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3136  hypothetical protein  34.51 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.932871  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2829  hypothetical protein  39.24 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.543485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1714  hypothetical protein  37.17 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671018  normal  0.409198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3863  hypothetical protein  36.21 
 
 
181 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6673  hypothetical protein  34.43 
 
 
170 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975454  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0390  hypothetical protein  47.54 
 
 
121 aa  62  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0930  hypothetical protein  30.83 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.849799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1352  hypothetical protein  30.97 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27643  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0606  hypothetical protein  32.32 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2179  hypothetical protein  35.35 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0449499  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0571  hypothetical protein  32.32 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1385  hypothetical protein  30.48 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497809  normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3844  protein of unknown function DUF983  29.5 
 
 
163 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0754377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1293  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3024  hypothetical protein  30.09 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0544  hypothetical protein  31.13 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7412  protein of unknown function DUF983  34.62 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1754  hypothetical protein  29.06 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2074  hypothetical protein  32.91 
 
 
136 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0271122  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1169  hypothetical protein  43.4 
 
 
132 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446143  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0418  hypothetical protein  32.91 
 
 
136 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5357  hypothetical protein  31.68 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.831164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2342  hypothetical protein  38.33 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000430301  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2821  hypothetical protein  37.35 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641842  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0159  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3981  hypothetical protein  36.92 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881431  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2682  hypothetical protein  45 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>