17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0389 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0389  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  261  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.317386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1648  hypothetical protein  53.78 
 
 
124 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.563063  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2391  hypothetical protein  41.98 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.469176  normal  0.286577 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3252  hypothetical protein  36.84 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.744419  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1859  hypothetical protein  32.54 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0713511  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0323  hypothetical protein  37.3 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7104  hypothetical protein  38.02 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1731  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0999577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5680  hypothetical protein  37.39 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.287697  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1011  hypothetical protein  30.97 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4454  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01710  hypothetical protein  30.7 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0608198  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4455  hypothetical protein  34.78 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1850  hypothetical protein  32.74 
 
 
128 aa  53.9  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00373006  normal  0.150652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2682  hypothetical protein  26.45 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11838  hypothetical protein  31.25 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4503  hypothetical protein  29.25 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.22274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>