21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2391 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2391  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  300  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.469176  normal  0.286577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7104  hypothetical protein  59.09 
 
 		 137 aa  163  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0389  hypothetical protein  41.98 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.317386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1859  hypothetical protein  35.2 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0713511  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01710  hypothetical protein  33.62 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0608198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1648  hypothetical protein  36.84 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.563063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1731  hypothetical protein  34.75 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0999577  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3252  hypothetical protein  37.5 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.744419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4454  hypothetical protein  32.58 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1011  hypothetical protein  37.82 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0323  hypothetical protein  37.04 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5680  hypothetical protein  33.04 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.287697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1850  hypothetical protein  33.06 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00373006  normal  0.150652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4455  hypothetical protein  31.67 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0165  hypothetical protein  36.36 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3877  hypothetical protein  40.68 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00430836  normal  0.195451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3257  hypothetical protein  25.6 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3581  protein of unknown function DUF983  25.6 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4503  hypothetical protein  29.6 
 
 		 137 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1293  hypothetical protein  31.76 
 
 		 150 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1385  hypothetical protein  30.59 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497809  normal  0.308816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>