16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3252 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3252  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  264  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.744419  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1011  hypothetical protein  54.33 
 
 
137 aa  150  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0389  hypothetical protein  36.84 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.317386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7104  hypothetical protein  39.2 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1859  hypothetical protein  35.9 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0713511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2391  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.469176  normal  0.286577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1731  hypothetical protein  33.9 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0999577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1648  hypothetical protein  33.62 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.563063  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01710  hypothetical protein  31.5 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0608198  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4454  hypothetical protein  34.21 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4455  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  60.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0323  hypothetical protein  31.62 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1850  hypothetical protein  34.86 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00373006  normal  0.150652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3877  hypothetical protein  25 
 
 
117 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00430836  normal  0.195451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0165  hypothetical protein  25 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5680  hypothetical protein  32.76 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.287697  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>