85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1973 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1973  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  285  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1558  protein of unknown function DUF983  79.67 
 
 		 130 aa  213  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.602074  normal  0.0157873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1055  protein of unknown function DUF983  82.5 
 
 		 122 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0431012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1611  hypothetical protein  75.19 
 
 		 137 aa  211  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0908  protein of unknown function DUF983  81.67 
 
 		 122 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0415  hypothetical protein  67.16 
 
 		 162 aa  189  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2765  hypothetical protein  62.7 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.934534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4734  protein of unknown function DUF983  56 
 
 		 128 aa  153  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2074  hypothetical protein  55.56 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.148673  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6977  protein of unknown function DUF983  60 
 
 		 128 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.906063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4739  protein of unknown function DUF983  58.12 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0123069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3291  hypothetical protein  57.14 
 
 		 135 aa  147  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4222  hypothetical protein  53.72 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.867791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4592  protein of unknown function DUF983  53.72 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0027  hypothetical protein  52.07 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431177  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0724  hypothetical protein  49.19 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0609  protein of unknown function DUF983  48.72 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0563  hypothetical protein  52.29 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0266  protein of unknown function DUF983  48.74 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.550192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6945  protein of unknown function DUF983  59.82 
 
 		 134 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3581  protein of unknown function DUF983  50.43 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3257  hypothetical protein  50.43 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0587  hypothetical protein  47.15 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.017099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2343  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  120  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.76851  normal  0.642219 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2484  hypothetical protein  52.25 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1249  protein of unknown function DUF983  52.14 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3453  protein of unknown function DUF983  48.7 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.412881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  44.72 
 
 		 439 aa  114  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0473  hypothetical protein  44.44 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0649  protein of unknown function DUF983  47.01 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.643544  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0674  hypothetical protein  48.67 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4642  hypothetical protein  48.33 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242788  normal  0.0997926 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0525  hypothetical protein  44.17 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4793  hypothetical protein  45.53 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1046  hypothetical protein  42.5 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52629  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0820  hypothetical protein  44.54 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4582  hypothetical protein  44.26 
 
 		 132 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2228  hypothetical protein  43.36 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519289  normal  0.0128796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0834  hypothetical protein  47.15 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0261  hypothetical protein  42.73 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3457  hypothetical protein  42.73 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.85085  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0767  hypothetical protein  45.9 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0905  protein of unknown function DUF983  42.06 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4735  hypothetical protein  36.28 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3673  hypothetical protein  36.63 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3573  hypothetical protein  34.43 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.717578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4500  hypothetical protein  35.59 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2237  hypothetical protein  36.11 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.483595  normal  0.0351044 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1400  hypothetical protein  35.54 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0606  hypothetical protein  33.64 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0571  hypothetical protein  33.64 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2417  hypothetical protein  34.31 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.000693417  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3035  hypothetical protein  35.29 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0408489  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3537  hypothetical protein  33.61 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0390  hypothetical protein  38.54 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2658  protein of unknown function DUF983  33.64 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3881  hypothetical protein  39.09 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2381  hypothetical protein  33.64 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3863  hypothetical protein  38.1 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6673  hypothetical protein  33.06 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975454  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2338  protein of unknown function DUF983  35.64 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1754  hypothetical protein  31.01 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3136  hypothetical protein  31.19 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.932871  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1385  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497809  normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1714  hypothetical protein  34.62 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671018  normal  0.409198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2829  hypothetical protein  39.19 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.543485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2439  hypothetical protein  34.31 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0760053  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3024  hypothetical protein  31.01 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0930  hypothetical protein  32.11 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.849799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1293  hypothetical protein  28.85 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206734 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2179  hypothetical protein  32.32 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0449499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7412  protein of unknown function DUF983  32.64 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1352  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0544  hypothetical protein  29.81 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3844  protein of unknown function DUF983  29.17 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0754377 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5357  hypothetical protein  29.75 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.831164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1169  hypothetical protein  44.23 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446143  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0159  hypothetical protein  32.35 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3981  hypothetical protein  30.16 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0418  hypothetical protein  33.03 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2074  hypothetical protein  33.03 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0271122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2342  hypothetical protein  31.25 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000430301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2821  hypothetical protein  43.48 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641842  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4455  hypothetical protein  26.96 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2682  hypothetical protein  45.24 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>