52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0135 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0135  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  475  1e-133  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.823284 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1121  hypothetical protein  72.27 
 
 		 256 aa  373  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1771  hypothetical protein  63.4 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10060  predicted nuclease of the RecB family  64.14 
 
 		 231 aa  294  8e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1075  protein of unknown function DUF91  62.55 
 
 		 231 aa  291  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.756006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08210  hypothetical protein  61.7 
 
 		 231 aa  290  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0876113  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2445  protein of unknown function DUF91  62.98 
 
 		 231 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.228433  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2599  hypothetical protein  62.13 
 
 		 231 aa  288  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1310  hypothetical protein  62.13 
 
 		 231 aa  286  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2332  hypothetical protein  61.7 
 
 		 231 aa  285  5.999999999999999e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000909296 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2401  hypothetical protein  58.3 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1229  hypothetical protein  60 
 
 		 225 aa  278  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19090  hypothetical protein  60.76 
 
 		 235 aa  275  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0350  protein of unknown function DUF91  58.05 
 
 		 225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1275  hypothetical protein  58.9 
 
 		 231 aa  272  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.319889  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29400  hypothetical protein  59.05 
 
 		 216 aa  270  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1782  hypothetical protein  58.72 
 
 		 226 aa  270  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1947  protein of unknown function DUF91  57.02 
 
 		 227 aa  268  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6124  hypothetical protein  56.17 
 
 		 219 aa  267  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1593  hypothetical protein  56.78 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.284759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3853  hypothetical protein  57.02 
 
 		 223 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3903  protein of unknown function DUF91  58.7 
 
 		 228 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3941  hypothetical protein  56.6 
 
 		 225 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323856  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3867  hypothetical protein  56.6 
 
 		 234 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4120  protein of unknown function DUF91  55.74 
 
 		 223 aa  260  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1261  protein of unknown function DUF91  55.74 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0749598  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2337  hypothetical protein  56.17 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.966132  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11352  hypothetical protein  55.32 
 
 		 226 aa  256  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3620  hypothetical protein  55.74 
 
 		 219 aa  254  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4002  hypothetical protein  55.74 
 
 		 219 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.308784  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1688  nuclease of the RecB family-like protein  54.55 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4308  hypothetical protein  54.89 
 
 		 223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0911  hypothetical protein  54.89 
 
 		 225 aa  250  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18140  hypothetical protein  54.85 
 
 		 231 aa  250  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.69216  normal  0.369141 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0664  hypothetical protein  51.91 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0762495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3695  hypothetical protein  54.24 
 
 		 220 aa  234  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.547538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2132  hypothetical protein  48.64 
 
 		 247 aa  231  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00447909  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1036  hypothetical protein  52.97 
 
 		 220 aa  231  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1011  protein of unknown function DUF91  49.79 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2601  protein of unknown function DUF91  29.02 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0608  hypothetical protein  29.3 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.454953 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0058  hypothetical protein  29.09 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000572818 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0240  hypothetical protein  29.11 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.691595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0168  hypothetical protein  26.79 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.916253  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0328  protein of unknown function DUF91  24.39 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0854  hypothetical protein  30.58 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.289907  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0027  protein of unknown function DUF91  25.34 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0508  hypothetical protein  29.27 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1741  hypothetical protein  30.65 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0757  hypothetical protein  26.96 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0174  hypothetical protein  28.06 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.263506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0699  RecB family-like nuclease  28.69 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>