53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29400 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29400  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  437  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6124  hypothetical protein  79.17 
 
 		 219 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2401  hypothetical protein  76.23 
 
 		 250 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1947  protein of unknown function DUF91  76.34 
 
 		 227 aa  340  7e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4308  hypothetical protein  74.55 
 
 		 223 aa  339  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11352  hypothetical protein  75.45 
 
 		 226 aa  338  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0350  protein of unknown function DUF91  74.32 
 
 		 225 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2337  hypothetical protein  74.55 
 
 		 223 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.966132  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1261  protein of unknown function DUF91  71.93 
 
 		 235 aa  333  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0749598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3941  hypothetical protein  73.64 
 
 		 225 aa  331  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323856  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3853  hypothetical protein  73.64 
 
 		 223 aa  331  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3867  hypothetical protein  73.64 
 
 		 234 aa  331  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3620  hypothetical protein  74.07 
 
 		 219 aa  331  6e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0911  hypothetical protein  75.23 
 
 		 225 aa  329  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4002  hypothetical protein  74.07 
 
 		 219 aa  328  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.308784  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3903  protein of unknown function DUF91  73.89 
 
 		 228 aa  325  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1688  nuclease of the RecB family-like protein  74.19 
 
 		 219 aa  325  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1229  hypothetical protein  72.07 
 
 		 225 aa  319  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4120  protein of unknown function DUF91  71.36 
 
 		 223 aa  318  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1593  hypothetical protein  70.64 
 
 		 234 aa  315  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.284759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1275  hypothetical protein  70.18 
 
 		 231 aa  313  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.319889  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08210  hypothetical protein  68.86 
 
 		 231 aa  310  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0876113  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18140  hypothetical protein  69.3 
 
 		 231 aa  309  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.69216  normal  0.369141 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0664  hypothetical protein  69.44 
 
 		 251 aa  307  6.999999999999999e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0762495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1310  hypothetical protein  67.98 
 
 		 231 aa  305  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1782  hypothetical protein  69.23 
 
 		 226 aa  305  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202038  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2332  hypothetical protein  67.11 
 
 		 231 aa  304  6e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000909296 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19090  hypothetical protein  65.52 
 
 		 235 aa  300  9e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10060  predicted nuclease of the RecB family  64.47 
 
 		 231 aa  299  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2132  hypothetical protein  63.67 
 
 		 247 aa  298  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00447909  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2599  hypothetical protein  65.35 
 
 		 231 aa  296  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3695  hypothetical protein  67.28 
 
 		 220 aa  291  6e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.547538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1036  hypothetical protein  67.28 
 
 		 220 aa  288  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2445  protein of unknown function DUF91  62.72 
 
 		 231 aa  286  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.228433  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1075  protein of unknown function DUF91  63.6 
 
 		 231 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.756006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1771  hypothetical protein  62.28 
 
 		 231 aa  280  9e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0135  hypothetical protein  59.05 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.823284 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1121  hypothetical protein  50.59 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1011  protein of unknown function DUF91  53.42 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  94  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.454953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2601  protein of unknown function DUF91  31.67 
 
 		 251 aa  90.1  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0328  protein of unknown function DUF91  28.46 
 
 		 286 aa  85.1  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0027  protein of unknown function DUF91  28.02 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0168  hypothetical protein  32.06 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.916253  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0240  hypothetical protein  26.05 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.691595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0058  hypothetical protein  30.99 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000572818 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0508  hypothetical protein  32.85 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0757  hypothetical protein  35.45 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0854  hypothetical protein  29.11 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.289907  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0174  hypothetical protein  32 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.263506 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1741  hypothetical protein  33 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5866  hypothetical protein  30.99 
 
 		 321 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0699  RecB family-like nuclease  29.32 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>