51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1947 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1947  protein of unknown function DUF91  100 
 
 
227 aa  461  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4308  hypothetical protein  81.06 
 
 
223 aa  374  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1261  protein of unknown function DUF91  75.64 
 
 
235 aa  371  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0749598  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11352  hypothetical protein  80.18 
 
 
226 aa  370  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2337  hypothetical protein  80.6 
 
 
223 aa  371  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.966132  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3867  hypothetical protein  79.3 
 
 
234 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3941  hypothetical protein  79.3 
 
 
225 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323856  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3853  hypothetical protein  79.74 
 
 
223 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00569345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6124  hypothetical protein  79.3 
 
 
219 aa  358  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2401  hypothetical protein  76.32 
 
 
250 aa  348  6e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4120  protein of unknown function DUF91  75.77 
 
 
223 aa  342  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0350  protein of unknown function DUF91  75.44 
 
 
225 aa  341  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29400  hypothetical protein  76.34 
 
 
216 aa  340  8e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3620  hypothetical protein  75.33 
 
 
219 aa  339  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4002  hypothetical protein  75.33 
 
 
219 aa  338  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.308784  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1229  hypothetical protein  72.69 
 
 
225 aa  329  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3903  protein of unknown function DUF91  75.45 
 
 
228 aa  327  9e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0911  hypothetical protein  73.25 
 
 
225 aa  325  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1688  nuclease of the RecB family-like protein  71.43 
 
 
219 aa  324  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1275  hypothetical protein  69.4 
 
 
231 aa  318  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.319889  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1782  hypothetical protein  69.16 
 
 
226 aa  316  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202038  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0664  hypothetical protein  69.6 
 
 
251 aa  314  8e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0762495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1593  hypothetical protein  69 
 
 
234 aa  312  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.284759  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19090  hypothetical protein  67.23 
 
 
235 aa  311  3.9999999999999997e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1310  hypothetical protein  67.53 
 
 
231 aa  309  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08210  hypothetical protein  67.53 
 
 
231 aa  309  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0876113  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18140  hypothetical protein  69.4 
 
 
231 aa  305  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.69216  normal  0.369141 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2599  hypothetical protein  66.38 
 
 
231 aa  305  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10060  predicted nuclease of the RecB family  66.23 
 
 
231 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2445  protein of unknown function DUF91  66.23 
 
 
231 aa  302  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.228433  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2332  hypothetical protein  64.66 
 
 
231 aa  301  6.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000909296 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1075  protein of unknown function DUF91  65.52 
 
 
231 aa  299  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.756006  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1771  hypothetical protein  64.22 
 
 
231 aa  297  8e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3695  hypothetical protein  68.42 
 
 
220 aa  296  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.547538  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1036  hypothetical protein  67.98 
 
 
220 aa  294  7e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2132  hypothetical protein  62.65 
 
 
247 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00447909  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0135  hypothetical protein  57.02 
 
 
235 aa  268  5e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.823284 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1121  hypothetical protein  50.78 
 
 
256 aa  251  7e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1011  protein of unknown function DUF91  51.74 
 
 
223 aa  211  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0608  hypothetical protein  31.46 
 
 
245 aa  82  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.454953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2601  protein of unknown function DUF91  31.67 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0168  hypothetical protein  32.78 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.916253  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0240  hypothetical protein  27.18 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.691595  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0058  hypothetical protein  31.94 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000572818 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0027  protein of unknown function DUF91  25.7 
 
 
236 aa  72  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0328  protein of unknown function DUF91  28.86 
 
 
286 aa  71.6  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0757  hypothetical protein  32.6 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0854  hypothetical protein  29.95 
 
 
240 aa  68.2  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.289907  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0508  hypothetical protein  30.73 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0174  hypothetical protein  30.1 
 
 
243 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.263506 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1741  hypothetical protein  31.79 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>